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硇洲岛潮汐带牡蛎相关可培养细菌多样性
引用本文:肖建青,朱泓溢,刘祝祥,刘荷,贺建武,李洪军,钟小娟,李文均,陈义光.硇洲岛潮汐带牡蛎相关可培养细菌多样性[J].微生物学通报,2013,40(6):939-950.
作者姓名:肖建青  朱泓溢  刘祝祥  刘荷  贺建武  李洪军  钟小娟  李文均  陈义光
作者单位:1. 吉首大学生物资源与环境科学学院 湖南吉首 416000
2. 云南大学省微生物研究所西南微生物多样性教育部重点实验室 云南昆明 650091
基金项目:国家自然科学基金项目(No. 30970007); 国家重点基础研究发展计划项目(No. 2010CB833800); 湖南省重点学科建设项目(No. JSU071312Z01); 湖南省高校科技创新团队支持计划项目(No. 201208Z01); 吉首大学项目(No. 11JDY060)
摘    要:目的]了解南海硇洲岛潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)相关可培养细菌的多样性.方法]应用纯培养法分离样品中的细菌(含放线菌),采用基于16S rRNA基因序列的系统发育分析方法研究这些分离菌株的生物多样性.结果]用补充0-25%(W/V) NaC1的MA、MH和NA培养基从样品中分离到102株细菌,在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取74个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析.结果表明,这些菌株归为38个物种,属于4个大的系统发育类群(Gamma-Proteobacteria,Alpha-Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes)的16个科、18个属.大多数菌株属于Gamma-Proteobacteria亚门(45株,60.8%),其余依次是Firmicutes门(12株,16.2%)、Bacteroidetes门(11株,14.9%)和Alpha-Proteobacteria亚门(6株,8.1%).大多数菌株与其系统发育关系最密切的有效发表种典型菌株之间(16S rRNA基因序列相似性为94.3%-99.8%)存在一定的遗传差异,其中JSM 111069可能代表Carnobacteriaceae科的潜在新属;菌株JSM 111039和JSM 111085可能分别代表Bacillus属的两个新物种,菌株JSM 111020、JSM 111072和JSM 111090可能分别代表Pseudoalteromonas、Proteus和Idiomarina属的新物种.结论]南海硇洲岛潮汐带牡蛎中存在较为丰富的原核生物多样性,并潜藏着一定数量的微生物新类群(物种).

关 键 词:南海  香港巨牡蛎  纯培养法  16S  rRNA基因  系统发育分析  细菌多样性

Biodiversity of culturable bacteria associated with Crassostrea hongkongensis from the tidal flat of Naozhou Island in the South China Sea
XIAO Jian-Qing,ZHU Hong-Yi,LIU Zhu-Xiang,LIU He,HE Jian-Wu,LI Hong-Jun,ZHONG Xiao-Juan,LI Wen-Jun and CHEN Yi-Guang.Biodiversity of culturable bacteria associated with Crassostrea hongkongensis from the tidal flat of Naozhou Island in the South China Sea[J].Microbiology,2013,40(6):939-950.
Authors:XIAO Jian-Qing  ZHU Hong-Yi  LIU Zhu-Xiang  LIU He  HE Jian-Wu  LI Hong-Jun  ZHONG Xiao-Juan  LI Wen-Jun and CHEN Yi-Guang
Institution:1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China;2. Key Laboratory of Microbial Diversity in Southwest China, Ministry of Education and Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources, Yunnan Institute of Microbiology, Yunnan University, Kunming, Yunnan 650091, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China
Abstract:
Keywords:the South China Sea  Crassostrea hongkongensis  Culture-dependent method  16S rRNA gene  Phylogenetic analysis  Bacterial diversity
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