| 林麝源蜡样芽孢杆菌SCBCM001株的分离鉴定及全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 刘洁,伍茜,丁慧,李依濛,付文龙,周磊,程建国,吴杰,杨凯惟,罗燕.林麝源蜡样芽孢杆菌SCBCM001株的分离鉴定及全基因组序列分析[J].微生物学通报,2023,50(9):4090-4108. |
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| 作者姓名： | 刘洁 伍茜 丁慧 李依濛 付文龙 周磊 程建国 吴杰 杨凯惟 罗燕 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物医学院, 四川 成都 611130;四川养麝研究所, 四川 都江堰 611800 |
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| 基金项目： | 四川省科技厅省级科研院所科技成果转化项目(2023JDZH0029) |
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| 摘 要： | 【背景】细菌性疾病是林麝规模化养殖的重要制约因素，蜡样芽孢杆菌曾在林麝化脓灶中检出，但是目前对林麝源蜡样芽孢杆菌的研究报道很少。【目的】对分离自病死林麝肝脏中的一株疑似蜡样芽孢杆菌进行分离鉴定和全基因组序列分析，为林麝相关疾病的防治奠定基础。【方法】将病原菌纯化培养后，对病原菌进行生化试验、药敏试验和小鼠致病性试验；并通过第3代单分子测序技术进行全基因组测序，根据测序结果进一步评估物种间的亲缘关系，并进行基因功能注释和遗传进化分析。【结果】该病原菌经平均核苷酸相似度分类和系统发育树分析属于蜡样芽孢杆菌群，生化结果符合蜡样芽孢杆菌的一般特征，将分离菌株命名为SCBCM001。该菌株对小鼠的半数致死量为8.3×107 CFU，对大多数β-内酰胺类、四环素和磺胺异噁唑耐药，对氨基糖苷类、头孢氨苄、头孢哌酮和亚胺培南等药物敏感；全基因组测序结果表明该菌株的染色体大小为5292570bp,GC含量为35.37%，多位点序列分型显示该菌株属于ST427序列类型。在菌株SCBCM001基因组内发现hblA、hblC、hblD、nheA、nheB、clo和cytK等多种毒力因子，同时菌株携带对β-内酰...
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| 关 键 词： | 林麝 蜡样芽孢杆菌 致病性 全基因组序列分析 |
| 收稿时间： | 2023/5/2 0:00:00 |
Isolation, identification, and whole genome sequencing of Bacillus cereus SCBCM001 from forest musk deer (Moschus berezovskii) |
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| LIU Jie,WU Xi,DING Hui,LI Yimeng,FU Wenlong,ZHOU Lei,CHENG Jianguo,WU Jie,YANG Kaiwei,LUO Yan.Isolation, identification, and whole genome sequencing of Bacillus cereus SCBCM001 from forest musk deer (Moschus berezovskii)[J].Microbiology,2023,50(9):4090-4108. |
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| Authors: | LIU Jie WU Xi DING Hui LI Yimeng FU Wenlong ZHOU Lei CHENG Jianguo WU Jie YANG Kaiwei LUO Yan |
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| Institution: | College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, Sichuan, China;Sichuan Institute of Musk Deer Breeding, Dujiangyan 611800, Sichuan, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | forest musk deer Bacillus cereus pathogenicity whole genome sequencing |
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