| 单分子实时测序技术在环境微生物研究中的应用 |
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| 引用本文： | 韩迎亚,杨乔乔,王倩楠,安贤惠,刘有华,李联泰.单分子实时测序技术在环境微生物研究中的应用[J].微生物学通报,2019,46(11):3140-3147. |
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| 作者姓名： | 韩迎亚 杨乔乔 王倩楠 安贤惠 刘有华 李联泰 |
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| 作者单位： | 江苏海洋大学 江苏 连云港 222005,江苏海洋大学 江苏 连云港 222005,江苏海洋大学 江苏 连云港 222005,江苏海洋大学 江苏 连云港 222005,江苏海洋大学 江苏 连云港 222005,江苏海洋大学 江苏 连云港 222005 |
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| 基金项目： | 江苏高校优势学科建设资助(PAPD)；江苏省研究生科研创新计划(KYCX18_2569)；江苏省研究生科研与实践创新计划(SJCX19_0989，SJCX19_0990) |
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| 摘 要： | 1975年，第一个cDNA的基因组——噬菌体фX174基因组的测序完成，标志着测序时代的开始。1996年以来人类基因组计划的发起极大地推动了测序技术的应用和发展，第二代测序技术也被称为高通量测序技术。而单分子DNA测序技术是最近10年内发展起来的新一代的测序技术，称为第三代测序技术，其中包括单分子实时测序(Single molecule real time sequencing，SMRT)、真正单分子测序和单分子纳米孔测序等技术。SMRT测序技术有超长读长、测序周期短、不需要模板扩增和直接检测表观修饰位点等特点，为研究人员提供了新的选择。本文综述了SMRT测序技术的基本原理、性能以及它在微生物16S rRNA基因、微生物全基因组以及微生物宏基因组测序等方面的应用，并分析了SMRT测序技术在环境微生物应用中的优势以及存在的问题。
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| 关 键 词： | Sanger测序法，SMRT测序技术，基因组学，环境微生物 |
Application of single molecule real time sequencing in environmental microorganisms research |
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| HAN Ying-Y,YANG Qiao-Qiao,WANG Qian-Nan,AN Xian-Hui,LIU You-Hua and LI Lian-Tai.Application of single molecule real time sequencing in environmental microorganisms research[J].Microbiology,2019,46(11):3140-3147. |
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| Authors: | HAN Ying-Y YANG Qiao-Qiao WANG Qian-Nan AN Xian-Hui LIU You-Hua and LI Lian-Tai |
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| Institution: | Jiangsu Ocean University, Lianyungang, Jiangsu 222005, China,Jiangsu Ocean University, Lianyungang, Jiangsu 222005, China,Jiangsu Ocean University, Lianyungang, Jiangsu 222005, China,Jiangsu Ocean University, Lianyungang, Jiangsu 222005, China,Jiangsu Ocean University, Lianyungang, Jiangsu 222005, China and Jiangsu Ocean University, Lianyungang, Jiangsu 222005, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sanger sequencing SMRT sequencing technology Genomics Environmental microorganisms |
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