| 南海硇洲岛潮汐带栉江珧可培养细菌的系统发育多样性 |
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| 引用本文： | 刘荷,朱泓溢,肖建青,刘祝祥,程金莲,贺建武,李文均,陈义光.南海硇洲岛潮汐带栉江珧可培养细菌的系统发育多样性[J].微生物学通报,2014,41(11):2216-2226. |
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| 作者姓名： | 刘荷 朱泓溢 肖建青 刘祝祥 程金莲 贺建武 李文均 陈义光 |
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| 作者单位： | 1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000;1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000;1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000；3. 酒鬼酒股份有限公司 湖南 吉首 416000;1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000;1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000;1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000;2. 云南大学省微生物研究所 西南微生物多样性教育部重点实验室 云南 昆明 650091;1. 吉首大学 生物资源与环境科学学院 湖南 吉首 416000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No. 30970007, 31460004)；国家973计划项目(No. 2010CB833800)；湖南省重点学科建设项目(No. JSU071312Z01)；湖南省高校科技创新团队支持计划(No. 201208Z01) |
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| 摘 要： | 【目的】研究南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品相关可培养细菌的多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S r RNA基因序列的系统发育分析,法对样品中可培养细菌(含放线菌)的类群多样性、物种多样性和遗传多样性进行研究。【结果】用补充0–25%(质量体积比)Na Cl的MA、MH和NA培养基从栉江珧样品中分离到125株细菌。在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取90个代表性菌株进行基于16S r RNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这90个分离菌株分属于3个大的系统发育类群(Gamma-proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria)、6个科、10个属,可分为33个物种。优势类群为厚壁菌门(Firmicutes)(56株,62.2%)和γ-变形杆菌亚门(Gamma-proteobacteria)(31株,34.5%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S r RNA基因序列相似性为95.7%–99.9%),其中有5株可能代表新的分类单元(Potential new taxa)。分析表明,菌株JSM 112024可能代表了盐单胞菌科(Halomonadaceae)的一个属一级新分类单元;菌株JSM 112019、JSM 114045、JSM 114058和JSM 114083可能分别代表盐弧菌属(Salinivibrio)、芽孢杆菌属(Bacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)和枝芽孢菌属(Virgibacillus)的新物种。【结论】湛江硇洲岛潮汐带栉江珧中存在较为丰富的可培养细菌物种多样性和系统发育多样性,并潜藏着较多的新微生物类群(物种)。
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| 关 键 词： | 南海 栉江珧 可培养细菌 S r RNA基因 系统发育分析 生物多样性 |
Phylogenetic diversity of cultivable bacteria associated with Atrina pectinata collected from the tidal flat of Naozhou Island in the South China Sea |
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| LIU He,ZHU Hong-Yi,XIAO Jian-Qing,LIU Zhu-Xiang,CHENG Jin-Lian,HE Jian-Wu,LI Wen-Jun and CHEN Yi-Guang.Phylogenetic diversity of cultivable bacteria associated with Atrina pectinata collected from the tidal flat of Naozhou Island in the South China Sea[J].Microbiology,2014,41(11):2216-2226. |
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| Authors: | LIU He ZHU Hong-Yi XIAO Jian-Qing LIU Zhu-Xiang CHENG Jin-Lian HE Jian-Wu LI Wen-Jun and CHEN Yi-Guang |
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| Institution: | 1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China; 3. Jiugui Liquor Co. Ltd., Jishou, Hunan 416000, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China;2. Key Laboratory of Microbial Diversity in Southwest China, Ministry of Education, Laboratory for Conservation and Utilization of Bio-Resources, Yunnan Institute of Microbiology, Yunnan University, Kunming, Yunnan 650091, China;1. College of Biology and Environmental Sciences, Jishou University, Jishou, Hunan 416000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | The South China Sea Atrina pectinata Cultivable bacteria 16S rRNA gene Phylogenetic analysis Biodiversity |
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