| 免培养法对大鲵肠道微生物多样性的研究 |
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| 引用本文： | 兰阿峰,杨曼,郭素芬,丁小维,邓百万,顾东升.免培养法对大鲵肠道微生物多样性的研究[J].微生物学通报,2014,41(7):1342-1349. |
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| 作者姓名： | 兰阿峰 杨曼 郭素芬 丁小维 邓百万 顾东升 |
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| 作者单位： | 1. 陕西理工学院 生物科学与工程学院 陕西 汉中 723001；2. 陕西省食药用菌工程研究中心 陕西 汉中 723001;1. 陕西理工学院 生物科学与工程学院 陕西 汉中 723001;1. 陕西理工学院 生物科学与工程学院 陕西 汉中 723001;1. 陕西理工学院 生物科学与工程学院 陕西 汉中 723001；2. 陕西省食药用菌工程研究中心 陕西 汉中 723001;1. 陕西理工学院 生物科学与工程学院 陕西 汉中 723001)；(2. 陕西省食药用菌工程研究中心 陕西 汉中 723001;3. 陕西省勉县第一中学 陕西 勉县 724200 |
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| 基金项目： | 陕西省科技厅科技统筹创新计划项目(No. 2012HBGC-20)；陕西理工学院人才引进启动项目 |
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| 摘 要： | 【目的】了解大鲵肠道内生细菌的组成及多样性。【方法】采用美国Mo Bio公司试剂盒提取大鲵肠道内容物总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rRNA基因特异性扩增,构建大鲵肠道内容物内生细菌16S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。【结果】根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的101个阳性克隆归为28个不同的可操作分类单元(OTUs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、梭菌门(Clostridia)、芽孢杆菌门(Bacilli)和衣原体门(Chlamydiae)4个门。其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的92.08%)为最优势类群。序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性。此外,还有一个OTU在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类。【结论】大鲵肠道内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元。
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| 关 键 词： | 免培养，大鲵，肠道微生物，多样性 |
Culture-independent analysis of intestinal microbial diversity from Chinese giant salamander |
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| LAN A-Feng,YANG Man,GUO Su-Fen,DING Xiao-Wei,DENG Bai-Wan and GU Dong-Sheng.Culture-independent analysis of intestinal microbial diversity from Chinese giant salamander[J].Microbiology,2014,41(7):1342-1349. |
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| Authors: | LAN A-Feng YANG Man GUO Su-Fen DING Xiao-Wei DENG Bai-Wan and GU Dong-Sheng |
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| Institution: | 1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi 723001, China; 2. Shaanxi Engineering Research Center of Edible and Medicated Fungi, Hanzhong, Shaanxi 723001, China;1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi 723001, China;1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi 723001, China;1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi 723001, China; 2. Shaanxi Engineering Research Center of Edible and Medicated Fungi, Hanzhong, Shaanxi 723001, China;1. School of Biological Science and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong, Shaanxi 723001, China; 2. Shaanxi Engineering Research Center of Edible and Medicated Fungi, Hanzhong, Shaanxi 723001, China;3. The First Mianxian Middle School of Shaanxi Province, Mianxian, Shaanxi 724200, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Culture-independent Chinese giant salamander (Andrias davidianus) Intestinal microbial Biodiversity |
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