| 深圳地区环境水体和人群中诺如病毒监测与分析 |
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| 引用本文： | 韩宁,汪东篱,张海龙,姚相杰,舒柏华,何雅青.深圳地区环境水体和人群中诺如病毒监测与分析[J].微生物学通报,2016,43(10):2166-2171. |
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| 作者姓名： | 韩宁 汪东篱 张海龙 姚相杰 舒柏华 何雅青 |
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| 作者单位： | 1. 华中科技大学同济医学院公共卫生学院 湖北 武汉 430000,2. 深圳市光明新区疾病预防控制中心 广东 深圳 518000,3. 深圳市疾病预防控制中心 广东 深圳 518000,3. 深圳市疾病预防控制中心 广东 深圳 518000,1. 华中科技大学同济医学院公共卫生学院 湖北 武汉 430000,3. 深圳市疾病预防控制中心 广东 深圳 518000 |
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| 基金项目： | 深圳市国家科技重大专项项目(No. GJHS20120628150935034) |
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| 摘 要： | 【目的】检测深圳地区环境水体和人群的诺如病毒(No Vs),探讨其是否在两者之间循环传播。【方法】2014年3月至2015年2月检测24份深圳茅洲河河水标本和287份腹泻患者粪便标本。河水标本经过混合纤维素酯膜和PEG法二次浓缩后提取核酸,粪便标本无需浓缩,稀释离心后直接提取核酸。应用实时荧光逆转录PCR初步分型,RT-PCR扩增ORF2保守区域衣壳蛋白(VP1)基因后测序确定亚型、分析不同来源病毒的同源性;同时建立基因进化树,进一步分析不同来源No Vs的亲缘关系。【结果】在河水标本和腹泻患者粪便标本中,No Vs阳性率分别为23.1%和17.4%,其中上下游河水标本阳性率分别为8.3%和41.7%,河水中No VGI型和No VGII型的阳性率为16.7%和8.3%。扩增阳性样本发现茅洲河水中检出No V主要是GI.6型,其次是GII.4 Sydney_2012型,而从腹泻胃肠炎患者粪便标本中检出No Vs主要是No VGII.4Sydney_2012型和少量的GII.3型。同时期水体和人群粪便标本来源的No VGII.4 Sydney_2012型VP1基因相似性98.2%–100.0%。【结论】No VGII.4 Sydney_2012型是深圳地区主要的流行株。No Vs在环境水体和人群中于某种程度上存在循环传播。
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| 关 键 词： | 诺如病毒，环境水体，人群 |
Surveillance and analysis of noroviruses in water environment and human population in Shenzhen |
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| HAN Ning,WANG Dong-Li,ZHANG Hai-Long,YAO Xiang-Jie,SHU Bai-Hua and HE Ya-Qing.Surveillance and analysis of noroviruses in water environment and human population in Shenzhen[J].Microbiology,2016,43(10):2166-2171. |
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| Authors: | HAN Ning WANG Dong-Li ZHANG Hai-Long YAO Xiang-Jie SHU Bai-Hua and HE Ya-Qing |
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| Institution: | 1. School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Hubei 430000, China,2. Shenzhen Guangming New District Center for Disease Control and Prevention, Shenzhen, Guangdong 518000, China,3. Shenzhen Center for Disease Control and Prevention, Shenzhen, Guangdong 518000, China,3. Shenzhen Center for Disease Control and Prevention, Shenzhen, Guangdong 518000, China,1. School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Hubei 430000, China and 3. Shenzhen Center for Disease Control and Prevention, Shenzhen, Guangdong 518000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Norovirus Water environment Human population |
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