| 基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望 |
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| 引用本文： | 陈亮宇,王玉梅,赵心清.基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望[J].微生物学通报,2013,40(10):1896-1908. |
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| 作者姓名： | 陈亮宇 王玉梅 赵心清 |
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| 作者单位： | 大连理工大学 生命科学与技术学院 辽宁 大连 116023;大连理工大学 生命科学与技术学院 辽宁 大连 116023;大连理工大学 生命科学与技术学院 辽宁 大连 116023 |
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| 基金项目： | 韩国Next-Generation BioGreen 21295项目(No. PJ0080932011) |
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| 摘 要： | 利用微生物的基因组信息预测其合成特定天然产物的潜能, 进而进行新化合物分离纯化和结构鉴定的基因组挖掘技术, 已经成为国内外研究的热点, 并在多种细菌和真菌的天然产物发现中得到成功应用。本文综述了基因组挖掘技术的最新进展, 包括生物信息分析和结构预测、基因组指导的天然产物的发现、沉默基因的激活和异源表达技术等, 以及我国学者开发的转录组挖掘技术, 并重点综述了影像质谱技术在基因组挖掘中的应用。目前对海洋放线菌进行基因组挖掘的研究还比较少, 而基因组挖掘技术的发展, 将极大地促进对海洋放线菌天然产物的发现和鉴定。未来除了充分挖掘可培养微生物的基因组, 对未培养微生物宏基因组的挖掘将进一步深入。此外, 除了开发利用基因组中合成天然产物的结构基因和调节基因, 还应该充分开发利用其他不同的遗传元件, 包括不同转录活性和响应不同环境条件和信号的启动子, 以及具有调节作用的RNA等。
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| 关 键 词： | 海洋放线菌 天然产物 基因簇 基因组挖掘 影像质谱 |
Nature product discovery of marine actinobacteria by genome mining: strategies and prospects |
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| CHEN Liang-Yu,WANG Yu-Mei and ZHAO Xin-Qing.Nature product discovery of marine actinobacteria by genome mining: strategies and prospects[J].Microbiology,2013,40(10):1896-1908. |
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| Authors: | CHEN Liang-Yu WANG Yu-Mei and ZHAO Xin-Qing |
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| Institution: | School of Life Science and Biotechnology, Dalian University of Technology, Dalian, Liaoning 116023, China;School of Life Science and Biotechnology, Dalian University of Technology, Dalian, Liaoning 116023, China;School of Life Science and Biotechnology, Dalian University of Technology, Dalian, Liaoning 116023, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Marine actinobacteria Natural products Gene cluster Genome mining Imaging mass spectrometry |
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