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大叶藻(Zostera marina)海草床沉积物细菌和古菌丰度及组成的垂直剖面特征
引用本文:郑鹏飞,张晓黎,龚骏.大叶藻(Zostera marina)海草床沉积物细菌和古菌丰度及组成的垂直剖面特征[J].微生物学通报,2020,47(6):1662-1674.
作者姓名:郑鹏飞  张晓黎  龚骏
作者单位:1 中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室 中国科学院烟台海岸带研究所 山东 烟台 264003;2 中国科学院大学 北京 100049;1 中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室 中国科学院烟台海岸带研究所 山东 烟台 264003;3 中山大学海洋科学学院 广东 珠海 519082
基金项目:中国科学院A类战略性先导科技专项(XDA23050303);国家自然科学基金(41676154,41976115);中国科学院前沿科学重点研究项目(QYZDB-SSW-DQC013,QYZDB-SSW-DQC041)
摘    要:【背景】海草床是重要的"蓝碳"生态系统,对全球碳汇有重要贡献。海草床沉积物剖面的垂直梯度特征显著,表层呈现氧化态,富含活性有机质,而深层呈还原态,以惰性有机质为主。【目的】探究这种垂直特征如何影响微生物的丰度和群落分布。【方法】利用荧光定量PCR和16SrRNA基因高通量测序等手段,测定了山东荣成天鹅湖大叶藻海草床不同深度(5、10、15、20、25和30 cm)沉积物中细菌和古菌丰度、多样性和群落结构的变化。【结果】细菌和古菌16S rRNA基因拷贝数随深度的增加而降低,在沉积物5cm深处,细菌的16SrRNA基因拷贝数显著高于20cm和30cm层(ANOVA,P0.05)。深度对细菌和古菌α多样性指数没有显著影响(P0.05)。细菌中相对丰度最高的是变形菌门,其次是绿弯菌门,拟杆菌门,浮霉菌门等,其中δ-变形菌和浮霉菌的相对丰度随深度显著增加(P0.05)。古菌群落中深古菌门比例最高,在25cm深处达到70%以上;其次是乌斯菌门、洛基古菌门、广古菌门和奇古菌门等。奇古菌门比例随深度增加而显著降低(P0.05),其他古菌类群在不同深度间差异不显著(P0.05)。【结论】海草床沉积物细菌和古菌的丰度、多样性和群落分布具有明显的垂直特征,这种特征可能受沉积物有机质组成和氧化还原状况影响。

关 键 词:海草床,垂直剖面,微生物群落结构,丰度,多样性

Vertical patterns of bacterial and archaeal abundance and community structure in seagrass (Zostera marina) meadow sediments
ZHENG Peng-Fei,ZHANG Xiao-Li,GONG Jun.Vertical patterns of bacterial and archaeal abundance and community structure in seagrass (Zostera marina) meadow sediments[J].Microbiology,2020,47(6):1662-1674.
Authors:ZHENG Peng-Fei  ZHANG Xiao-Li  GONG Jun
Institution:1 Key Laboratory of Coastal Environmental Processes and Ecological Remediation, Chinese Academy of Sciences, Yantai Institute of Coastal Zone Research, Chinese Academy of Sciences, Yantai, Shandong 264003, China;2 University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, Beijing 100049, China; 1 Key Laboratory of Coastal Environmental Processes and Ecological Remediation, Chinese Academy of Sciences, Yantai Institute of Coastal Zone Research, Chinese Academy of Sciences, Yantai, Shandong 264003, China;3 School of Marine Sciences, Sun Yat-Sen University, Zhuhai, Guangdong 519082, China
Abstract:
Keywords:Seagrass meadow  Vertical patterns  Microbial community structure  Abundance  Diversity
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