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基于PCR-DGGE和高通量测序分析白云边酒窖泥细菌群落结构与多样性
引用本文:黄莹娜,熊小毛,胡远亮,梁运祥,赵述淼.基于PCR-DGGE和高通量测序分析白云边酒窖泥细菌群落结构与多样性[J].微生物学通报,2017,44(2):375-383.
作者姓名:黄莹娜  熊小毛  胡远亮  梁运祥  赵述淼
作者单位:1. 华中农业大学生命科学技术学院 农业微生物学国家重点实验室 湖北 武汉 430070,2. 湖北白云边酒业股份有限公司 湖北 松滋 434200,3. 湖北师范大学生命科学学院 湖北 黄石 435002,1. 华中农业大学生命科学技术学院 农业微生物学国家重点实验室 湖北 武汉 430070,1. 华中农业大学生命科学技术学院 农业微生物学国家重点实验室 湖北 武汉 430070
基金项目:中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(No. 2014JC004);湖北省自然科学基金(No. 2015CFC797)
摘    要:【目的】探索白云边酒不同窖龄窖泥细菌群落结构及其多样性,分析窖泥细菌群落特征对兼香型白酒风格形成的影响。【方法】分别提取2年和23年窖泥样品总DNA,采用PCR-DGGE、基因克隆以及高通量测序技术,研究窖泥细菌的分布情况。【结果】白云边窖泥细菌归属于变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)4个菌门。2、23年窖泥共同的优势菌属(≥1.0%)包括棒状杆菌属(Corynebacterium)、香味菌属(Myroides)、鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)、梭菌属(Clostridium)、醋杆菌属(Acetobacter)、产碱杆菌属(Alcaligenes)、肠杆菌属(Enterobacter)和不动杆菌属(Acinetobacter)。2年窖泥特有优势菌属为Dysgonomonas、Fluviicola、变形杆菌属(Proteus)和Wohlfahrtiimonas,而23年窖泥特有优势菌属为葡萄球菌属(Staphylococcus)、Hazenella、魏斯氏菌属(Weissella)、葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)和摩根氏菌属(Morganella)。【结论】2年窖泥细菌群落多样性高于23年窖泥。比较了白云边两种窖龄窖泥主要细菌组成情况,为研究微生物对白云边酒浓酱兼香型独特风味形成的影响提供依据。

关 键 词:PCR-DGGE,高通量测序,窖泥,16S  rRNA基因,细菌群落

Bacterial community and diversity in pit mud of Baiyunbian liquor analyzed by PCR-DGGE and high-throughput sequencing
HUANG Ying-N,XIONG Xiao-Mao,HU Yuan-Liang,LIANG Yun-Xiang and ZHAO Shu-Miao.Bacterial community and diversity in pit mud of Baiyunbian liquor analyzed by PCR-DGGE and high-throughput sequencing[J].Microbiology,2017,44(2):375-383.
Authors:HUANG Ying-N  XIONG Xiao-Mao  HU Yuan-Liang  LIANG Yun-Xiang and ZHAO Shu-Miao
Institution:1. College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei 430070, China,2. Baiyunbian Company Limited of Hubei Province, Songzi, Hubei 434200, China,3. College of Life Science Hubei Normal University, Huangshi, Hubei 435002, China,1. College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei 430070, China and 1. College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, Hubei 430070, China
Abstract:
Keywords:PCR-DGGE  High-throughput sequencing  Pit mud  16S rRNA gene  Bacterial community
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