| 临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系 |
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| 引用本文： | 郭向娇,王颖芳,段广才,王琳琳,王鹏飞,杨海燕,郗园林.临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系[J].微生物学通报,2015,42(3):543-549. |
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| 作者姓名： | 郭向娇 王颖芳 段广才 王琳琳 王鹏飞 杨海燕 郗园林 |
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| 作者单位： | 1. 郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001,2. 河南科技大学 预防医学教研室 河南 洛阳 471023,1. 郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001；3. 新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心 河南 新乡 453003,1. 郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001,1. 郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001,1. 郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001,1. 郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001 |
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| 基金项目： | 国家科技重大专项项目(No. 2013ZX10004607) |
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| 摘 要： | 【目的】了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系。【方法】以聚合酶链式反应(PCR)方法，采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因ipaH、ial、ipaBCD、virA进行检测。对CRISPR1的PCR结果进行测序，并用CRISPR finder在线软件对CRISPR1基因座进行分析。通过卡方检验初步分析CRISPR/Cas系统与毒力基因的关系。【结果】测序结果显示，CRISPR1基因座中间隔序列数目较少且在不同菌株间一致性较高；57株志贺菌中，84.2% (48/57)的志贺菌中可检测到CRISPR/Cas系统，其中68.8% (33/48)的志贺菌中cas6e-cas5基因或(和) cse2基因中发现插入序列；毒力基因ipaH、ial、virA、ipaBCD的检出率依次为100%、100%、98.2%和87.7%；毒力基因ipaBCD的阳性率与活性CRISPR/Cas系统的分布无关(P>0.05)。【结论】CRISPR/Cas系统广泛存在于临床分离志贺菌中；部分cas基因中有插入序列；并未发现志贺菌中活性CRISPR/Cas系统与毒力基因的分布有关。
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| 关 键 词： | 志贺菌，CRISPR/Cas系统，聚合酶链式反应，插入序列，毒力基因 |
Distribution of CRISPR/Cas system in Shigella clinical strains and its relationship with virulence genes |
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| GUO Xiang-Jiao,WANG Ying-Fang,DUAN Guang-Cai,WANG Lin-Lin,WANG Peng-Fei,YANG Hai-Yan and XI Yuan-Lin.Distribution of CRISPR/Cas system in Shigella clinical strains and its relationship with virulence genes[J].Microbiology,2015,42(3):543-549. |
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| Authors: | GUO Xiang-Jiao WANG Ying-Fang DUAN Guang-Cai WANG Lin-Lin WANG Peng-Fei YANG Hai-Yan and XI Yuan-Lin |
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| Institution: | 1. Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan 450001, China,2. Department of Preventive Medicine, Henan University of Science and Technology, Luoyang, Henan 471023, China,1. Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan 450001, China; 3. Henan Innovation Center of Molecular Diagnosis and Laboratory Medicine, Xinxiang Medical University, Xinxiang, Henan 453003, China,1. Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan 450001, China,1. Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan 450001, China,1. Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan 450001, China and 1. Department of Epidemiology, College of Public Health, Zhengzhou University, Zhengzhou, Henan 450001, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Shigella CRISPR/Cas system PCR Insertion sequence Virulence gene |
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