| ARDRA分型测定刺参养殖环境中蛭弧菌多样性 |
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| 引用本文： | 韩民泳,陈慧黠,斯晗,刘洋,陈亚东.ARDRA分型测定刺参养殖环境中蛭弧菌多样性[J].微生物学通报,2016,43(2):254-261. |
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| 作者姓名： | 韩民泳 陈慧黠 斯晗 刘洋 陈亚东 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室 辽宁 大连 116023,大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室 辽宁 大连 116023,大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室 辽宁 大连 116023,大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室 辽宁 大连 116023,大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室 辽宁 大连 116023 |
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| 基金项目： | 辽宁省教育厅计划项目(No. L2012255) |
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| 摘 要： | 【目的】研究刺参养殖环境中蛭弧菌类微生物的多样性及其组成特征。【方法】对刺参养殖用水进行过滤,获得微生物并提取其总DNA,分别采用两对特异性引物Per和Bac扩增蛭弧菌类微生物相应的16S r RNA基因目的片段。通过核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析(ARDRA)方法,使用HaeⅢ和MspⅠ,双酶切各60个目的基因的单克隆,选不同条带克隆进行测序并对测序结果的多重序列分析比对。【结果】确定两对引物分别存在8和9种碱基差异序列,均属于噬菌弧菌属,分属于3个类群中。类群Ⅰ、Ⅱ为优势类群,且均为已知类群,类群Ⅲ为潜在的新类群;Per1(KP214541)和Bac44(KP214551)代表菌株分别为优势种。【结论】刺参养殖环境中蛭弧菌具有较高的多样性,包括已知类型和未知类型的蛭弧菌;可进一步进行蛭弧菌的分离、培养,用于刺参养殖中病害防治研究。
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| 关 键 词： | 刺参，养殖环境，蛭弧菌类微生物，核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析，16S rRNA基因，多样性 |
ARDRA analysis of diversity of Bdellovibrio-and-like organisms in mariculture environment of Apostichopus japonicus |
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| HAN Min-Yong,CHEN Hui-Xi,SI Han,LIU Yang and CHEN Ya-Dong.ARDRA analysis of diversity of Bdellovibrio-and-like organisms in mariculture environment of Apostichopus japonicus[J].Microbiology,2016,43(2):254-261. |
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| Authors: | HAN Min-Yong CHEN Hui-Xi SI Han LIU Yang and CHEN Ya-Dong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Apostichopus japonicus Mariculture environment Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs) Amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) 16S rRNA gene Diversity |
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