林麝源支气管败血波氏杆菌FMDBb1株的分离鉴定及全基因组序列分析

背景] 呼吸系统疾病是圈养麝常见疾病之一，其中部分由支气管败血波氏杆菌引起，但目前关于林麝源支气管败血波氏杆菌的研究甚少。目的] 对分离自患病林麝鼻黏液的一株疑似支气管败血波氏杆菌进行分离鉴定和全基因组序列分析，为林麝相关疾病的防治奠定基础。方法] 将病原菌纯化培养后，通过菌落形态和生化试验初步鉴定病原菌类型，然后进行药敏试验和小鼠致病性试验以观察其耐药和毒力表型，最后对其进行全基因组测序，通过平均核苷酸一致性（Average Nucleotide Identity，ANI）比对在全基因组水平进一步评估物种间的亲缘关系，并进行基因功能注释和遗传进化分析。结果] 该病原菌经ANI分类属于经典波氏杆菌亚种，结合菌落形态和生化结果综合鉴定为支气管败血波氏杆菌，菌株命名为FMDBb1，药敏表型显示其对林可霉素、利福平及大多数β-内酰胺类抗生素耐药，对小鼠的半数致死量为8.55×10⁶ CFU。全基因组测序显示该菌基因组大小为5 133 936 bp，基因功能注释显示其拥有强代谢能力，基因组内检测到65个经典波氏杆菌毒力因子，以及1个粉霉素和1个利福平的靶向耐药基因，同时发现19个插入序列和1个噬菌体区域的存在。序列类型为ST33，克隆复合体类型为CC6，管家基因联合建树分析显示与分离于韩国短毛猫的KVNON-570株相似性最高。结论] 研究分离了林麝源支气管败血波氏杆菌并对其进行了全基因组测序及分析，为该病原菌感染的防治提供了宝贵的信息。

Isolation, identification and whole-genome analysis of Bordetella bronchiseptica FMDBb1 from forest musk deer (Moschus berezovskii)