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难培养菌的多条带PCR产物产生原因分析
引用本文:许美容,贾奥琳,陶阳,邓晓玲.难培养菌的多条带PCR产物产生原因分析[J].微生物学通报,2015,42(4):783-790.
作者姓名:许美容  贾奥琳  陶阳  邓晓玲
作者单位:华南农业大学资源环境学院 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 广东 广州 510642,华南农业大学资源环境学院 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 广东 广州 510642,华南农业大学资源环境学院 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 广东 广州 510642,华南农业大学资源环境学院 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 广东 广州 510642
基金项目:农业部公益性行业(农业)专项项目(No. 201003067);广东省自然科学基金项目(No. S2012040007627)
摘    要:【目的】分析严重威胁柑橘产业发展的毁灭性病害——柑橘黄龙病的强致病性病原亚洲种“Candidatus Liberibacter asiaticus”的种群多样性研究中出现多条带PCR产物的原因,为难培养菌的分子生物学研究提供参考。【方法】通过使用PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和测序相结合分析“Ca. L. asiaticus”基因组上2个短串联重复(Short tandem repeats,STR)基因的PCR产物。【结果】单个菌株可扩增获得多个PCR条带且其扩增产物多态性受寄主品种影响;这2个STR基因的PCR产物在菌株间呈明显的多态性;扩增所获得的序列可来自“Ca. L. asiaticus”本身,也可来自其寄主或内生菌。【结论】难培养菌的STR基因PCR产物多态性产生的主要原因是该基因内部的串联重复序列数目存在差异,但目的菌及外源物种(寄主或内生菌等)基因组的非特异性扩增也是影响其多态性的因素。

关 键 词:柑橘黄龙病,短串联重复,多态条带,共生菌,难培养菌

Analysis on causes of polymorphic PCR bands in nonculturable endophytes amplification
XU Mei-Rong,JIA Ao-Lin,TAO Yang and DENG Xiao-Ling.Analysis on causes of polymorphic PCR bands in nonculturable endophytes amplification[J].Microbiology,2015,42(4):783-790.
Authors:XU Mei-Rong  JIA Ao-Lin  TAO Yang and DENG Xiao-Ling
Institution:Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control, College of Resources and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510642, China,Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control, College of Resources and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510642, China,Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control, College of Resources and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510642, China and Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control, College of Resources and Environment, South China Agricultural University, Guangzhou, Guangdong 510642, China
Abstract:
Keywords:Huanglongbing  Short tandem repeats  Multi-band  Endophytes  Nonculturable
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