环境胁迫和非胁迫条件下类植物乳杆菌转录组分析 |
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引用本文: | 闫洪波,张香美,许冬倩.环境胁迫和非胁迫条件下类植物乳杆菌转录组分析[J].微生物学通报,2018,45(2):405-412. |
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作者姓名: | 闫洪波 张香美 许冬倩 |
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作者单位: | 河北经贸大学生物科学与工程学院 河北 石家庄 050061,河北经贸大学生物科学与工程学院 河北 石家庄 050061,河北经贸大学生物科学与工程学院 河北 石家庄 050061 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31471707) |
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摘 要: | 【背景】类植物乳杆菌L-ZS9是一株在食品发酵与保鲜方面具有潜在应用价值的产细菌素益生菌。【目的】深入了解环境胁迫影响类植物乳杆菌L-ZS9细菌素合成的重要相关调节基因的信息。【方法】通过高通量测序技术对类植物乳杆菌转录组进行测序,对所有转录本进行COG(Clusters of Orthologous Groups)、GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分类和Pathway注释。【结果】转录组测序显示2个样品基因覆盖度都在90%以上,差异表达基因927个,其中744个上调,183个下调。KEGG分析结果表明,649个差异表达基因中68个集中在"ABC转运途径",占10.48%,其中3个基因表达上调超过16倍,1个基因表达下调超过1/16,暗示类植物乳杆菌L-ZS9细菌素合成与"ABC转运途径"密切相关。另外多个孤儿基因表达变化也超过16倍,有的甚至表达上调达万倍。【结论】进一步拓展了类植物乳杆菌的基因信息,为类植物乳杆菌细菌素代谢途径和逆境反应研究提供了坚实的基础。
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关 键 词: | 乳杆菌,转录组,基因表达,环境胁迫,细菌素 |
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