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大肠杆菌拓扑异构酶I结合重金属的特性及功能影响
引用本文:王晓冰,陈世良,吴卉卉,黄招竹,姜风英,王伍,杨娟娟.大肠杆菌拓扑异构酶I结合重金属的特性及功能影响[J].微生物学通报,2018,45(2):347-356.
作者姓名:王晓冰  陈世良  吴卉卉  黄招竹  姜风英  王伍  杨娟娟
作者单位:1. 温州医科大学附属第一医院风湿免疫科 浙江 温州 325000,2. 温州医科大学检验医学院 生命科学学院 浙江 温州 325000,3. 温州医科大学附属第一医院重症医学科 浙江 温州 325000,2. 温州医科大学检验医学院 生命科学学院 浙江 温州 325000,2. 温州医科大学检验医学院 生命科学学院 浙江 温州 325000,2. 温州医科大学检验医学院 生命科学学院 浙江 温州 325000,2. 温州医科大学检验医学院 生命科学学院 浙江 温州 325000
基金项目:浙江省自然科学基金(LY13C050003);浙江省公益技术研究项目(2016C33027);浙江省大学生科技创新活动计划(新苗人才计划) (2016R413073);温州医科大学人才启动基金(QTJ15013)
摘    要:【背景】大肠杆菌拓扑异构酶Ⅰ(Escherichia coli topoisomerase I,E.coli TopA)在DNA复制、转录、重组和基因表达调控等过程发挥关键作用。研究表明E.coli TopA只有结合锌离子才具有活性,然而E.coli TopA能否结合其他金属离子尤其是重金属离子,以及结合其他金属后是否具有活性,目前仍不清楚。【目的】探究大肠杆菌拓扑异构酶Ⅰ是否结合环境中常见重金属离子,研究重金属离子结合E.coli TopA蛋白后对其活性的影响。【方法】在分别添加有锌、钴、镍、镉、铁、汞、砷、铬、铅、铜离子的M9基础培养中表达、纯化出E.coli TopA蛋白,并对纯化得到的蛋白用电感耦合等离子体质谱仪进行相应金属离子含量的测定;利用表达E.coli TopA锌指结构的突变体蛋白鉴定重金属离子的结合位点;通过体外超螺旋DNA松弛实验测定不同金属结合E.coli TopA的拓扑异构酶活性;通过测定蛋白内源性荧光推测不同金属结合E.coli TopA的空间构象差异。【结果】E.coli TopA在体内除了能结合锌和铁之外,还能够结合钴、镍、镉3种离子,但是不能结合汞、砷、铬、铅、铜离子。钴、镍、镉结合形式的E.coli TopA,每个蛋白分子最多可以结合3个相应的金属离子,他们与TopA蛋白的结合位点也是位于3个锌指结构域,而且每个锌指结构域结合1个金属离子。此外,E.coli TopA结合钴、镍、镉离子后,其DNA拓扑异构酶活性并未受到影响,可能是由于钴、镍、镉离子结合形式的E.coli TopA蛋白,其空间构象与锌结合形式相比并未发生显著变化。【结论】由于DNA拓扑异构酶在维持细胞正常生理功能中发挥关键作用,研究表明E.coli TopA的功能不会受到常见重金属的干扰(不结合或者结合后活性无影响),这也有可能是大肠杆菌在进化过程中产生的对抗环境中重金属离子毒害作用的一种自我保护和耐受机制,具有重要的生理意义。

关 键 词:大肠杆菌拓扑异构酶I,重金属结合,拓扑异构酶活性,锌指结构

Effect of heavy metal binding on the function of Escherichia coli topoisomerase I
WANG Xiao-Bing,CHEN Shi-Liang,WU Hui-Hui,HUANG Zhao-Zhu,JIANG Feng-Ying,WANG Wu and YANG Juan-Juan.Effect of heavy metal binding on the function of Escherichia coli topoisomerase I[J].Microbiology,2018,45(2):347-356.
Authors:WANG Xiao-Bing  CHEN Shi-Liang  WU Hui-Hui  HUANG Zhao-Zhu  JIANG Feng-Ying  WANG Wu and YANG Juan-Juan
Institution:1. Department of Rheumatology, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China,2. School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China,3. Department of Intensive Care Medicine, The First Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China,2. School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China,2. School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China,2. School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China and 2. School of Laboratory Medicine and Life Sciences, Wenzhou Medical University, Wenzhou, Zhejiang 325000, China
Abstract:
Keywords:Escherichia coli TopA  Heavy metal binding  Topoisomerase activity  Zinc-finger motif
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