普通烟草ATⅢ氨基转移酶家族序列鉴定与表达分析 |
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引用本文: | 王晓,王大伟,夏菲,李晓旭,吴华,姜山,孙玉合.普通烟草ATⅢ氨基转移酶家族序列鉴定与表达分析[J].基因组学与应用生物学,2019(1):251-259. |
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作者姓名: | 王晓 王大伟 夏菲 李晓旭 吴华 姜山 孙玉合 |
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作者单位: | 中国农业科学院烟草研究所烟草行业烟草基因资源利用重点实验室 |
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基金项目: | 中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-TRIC02)资助 |
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摘 要: | 氨基转移酶是5'-磷酸吡哆醛依赖酶,在植物的生长发育和非生物胁迫的反应中起重要作用。ATⅢ氨基转移酶家族(classⅢ aminotransferase family)是转氨酶家族中一个非常重要的亚家族。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组序列信息,鉴定出26个ATⅢ家族成员,对烟草ATⅢ家族进行理化性质分析表明,普通烟草ATⅢ家族成员之间的理化性质差异较大;系统进化和结构域分析显示,烟草ATⅢ家族成员可形成4个分支,同一分支内ATⅢ家族成员的保守结构域的种类和组织形式高度一致;将19个家族成员定位在12条染色体上;分析普通烟草转录组数据,结果显示大多数家族成员在不同组织中都有表达,主要集中在叶脉、打顶后茎和叶、离体叶片等组织。对NtATⅢ1和NtATⅢ2基因的qRT-PCR分析显示,这两个基因主要在植物地上组织中表达。本研究为普通烟草ATⅢ基因的功能研究提供依据。
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关 键 词: | ATⅢ氨基转移酶家族 普通烟草 生物信息学分析 |
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