| 日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 孙威,申欢,陈婷,彭贵,潘蓉蓉,鞠志刚.日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2019,38(1):233-238. |
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| 作者姓名： | 孙威 申欢 陈婷 彭贵 潘蓉蓉 鞠志刚 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学,生命科学学院,植物生理发育调控重点实验,贵阳,550025;贵阳中医学院,药学院,贵阳,550025 |
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| 基金项目： | 贵州省项目;贵州师范大学博士科研项目;贵州省重点实验室建设项目;国家自然科学基金;教育部长江学者和创新团队发展计划项目 |
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| 摘 要： | 花青素还原酶(anthocyanidin reductase, ANR)是原花青素合成途径中的关键酶,同时花青素还原酶对植物花色苷的积累也发挥着重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,以其转录组测序结果为基础,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到日本蛇根草ANR基因完整的cDNA序列,利用生物信息学方法和工具对日本蛇根草ANR基因的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽、二级结构等进行预测和分析。结果表明,该基因cDNA全长为1 020 bp,编码339个氨基酸,预测其蛋白分子量为36.37 kD,等电点为5.92,为亲水蛋白,不含信号肽序列。综上,本研究成功克隆获得日本蛇根草ANR基因并完成其生物信息学分析,研究结果将为解析该基因的功能奠定基础。
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| 关 键 词： | 日本蛇根草 ANR 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of ANR Gene in Ophiorrhiza japonica |
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| Sun Wei,Shen Huan,Chen Ting,Peng Gui,Pan Rongrong,Ju Zhigang.Cloning and Bioinformatics Analysis of ANR Gene in Ophiorrhiza japonica[J].Genomics and Applied Biology,2019,38(1):233-238. |
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| Authors: | Sun Wei Shen Huan Chen Ting Peng Gui Pan Rongrong Ju Zhigang |
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| Institution: | (Key Laboratory of Plant Physiology and Development Regulation,College of Life Science,Guizhou Normal University,Guiyang,550025;Medicine College,Guiyang University of Chinese Medicine,Guiyang,550025) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ophiorrhizajaponica ANR Gene cloning Bioinformatics analysis |
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