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鳙基于10个微卫星标记的亲子鉴定分析
引用本文:张丹,傅建军,张利德,方敏,朱文彬,王兰梅,苏胜彦,董在杰.鳙基于10个微卫星标记的亲子鉴定分析[J].基因组学与应用生物学,2019(7).
作者姓名:张丹  傅建军  张利德  方敏  朱文彬  王兰梅  苏胜彦  董在杰
作者单位:南京农业大学无锡渔业学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室;苏州市未来水产养殖场
摘    要:为开展鳙(Hypophthalmichthys nobilis)家系选育工作,本研究进行了基于微卫星标记的亲子鉴定研究。试验中筛选了10个扩增效率较高的微卫星标记,通过引物荧光修饰,引物结合毛细管电泳分型技术,对鳙48尾亲本及384尾子代进行了基因分型,并计算了等位基因频率和模拟分析和亲子鉴定等分析。结果发现,各位点的等位基因数介于4~13之间,其中9个位点均具有较高的多态性和杂合度(PIC0.5, He0.5),研究发现位点的多态性信息含量(PIC)与亲本对排除率(E-PP)存在显著正相关(p0.01)。模拟分析结果显示,该10个标记预计可用于已知性别的50组亲本(100尾)或未知性别的50尾亲本的鉴定分析(鉴别成功率95%)。亲子鉴定发现,对试验中2个交配组(每组12对亲本)的鉴别成功率分别为98.96%和100%;且父母本对子代的贡献率存在极显著差异(p0.01)。通过累积位点的鉴定分析发现,当标记数为7个和9个时分别能满足试验中12组和24组亲本对应子代的鉴定分析(鉴别率95%),模拟分析和亲子鉴定分析成功率趋势基本符合。本研究所开发的亲子鉴定技术可为鳙家系选育提供技术支持。

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