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| 三种人参属植物的EST-SSR信息分析及其在三七中的应用 | |
| 引用本文： | 杨维泽,金航,崔秀明,沈涛,杨美权,张金渝.三种人参属植物的EST-SSR信息分析及其在三七中的应用[J].基因组学与应用生物学,2011,30(1). |
| 作者姓名： | 杨维泽 金航 崔秀明 沈涛 杨美权 张金渝 |
| 作者单位： | 1. 云南省农业科学院药用植物研究所,昆明,650223;昆明理工大学生命科学与技术学院,昆明,650091 2. 文山三七科学院,文山,663000 3. 云南省农业科学院药用植物研究所,昆明,650223 |
| 基金项目： | 国家"十一五"科技支撑项目，云南省自然科学基金项目 |
| 摘 要： | 为了解人参属植物EST中SSR分布特点及其在三七SSR标记中的应用,利用生物信息学方法,用primer 3软件对dbEST数据库中人参属植物人参、西洋参和三七的EST序列进行搜索,发现人参属植物EST-SSR出现频率为11.54%,平均每4.39 kb出现1个SSR.人参属植物单核苷酸重复基元占主导地位,其次为三核苷酸重复基元和二核苷酸重复基元,分别占总SSR的54.48%、17.31%和16.36%.人参属EST-SSR的优势类型为A/T和AT/TA,分别占54.73%和8.21%.根据人参属植物EST中的SSR设计48对引物,在合适的PCR扩增体系下,用5个三七样品的DNA为模板进行PCR扩增,引物有效扩增率85.42%,其中多态性引物占可扩增引物的70.73%.结果表明,利用人参属EST序列开发三七EST-SSR标记是可行的. |
| 关 键 词： | 人参属 三七 |
Analysis on EST-SSR of Three Species in Genus Panax and the Application in Panax notoginseng |
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| Yang Weize,Jin Hang,Cui Xiuming,Shen Tao,Yang Meiquan,Zhang Jinyu.Analysis on EST-SSR of Three Species in Genus Panax and the Application in Panax notoginseng[J].Genomics and Applied Biology,2011,30(1). | |
| Authors: | Yang Weize Jin Hang Cui Xiuming Shen Tao Yang Meiquan Zhang Jinyu |
| Abstract: | |
| Keywords: | EST-SSR |
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