| 中国96个荔枝种质资源的EST-SSR遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 向旭,欧良喜,陈厚彬,孙清明,陈洁珍,蔡长河,白丽军,赵俊生.中国96个荔枝种质资源的EST-SSR遗传多样性分析[J].基因组学与应用生物学,2010,29(6). |
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| 作者姓名： | 向旭 欧良喜 陈厚彬 孙清明 陈洁珍 蔡长河 白丽军 赵俊生 |
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| 基金项目： | 国家荔枝产业技术体系(岗位专家任务)建设专项资金、，广东省现代农业产业技术体系(岭南水果创新团队荔枝育种岗位任务)建设专项资金项目，广东省农业科学院科技支撑项目 |
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| 摘 要： | 根据本实验室已获得的荔枝果皮cDNA文库EST序列,通过SSRIT在线检索,从3391条EST序列中,发现305条含有SSR,占整个文库EST的8.99%。利用SSR-ESTs序列共设计100对EST-SSR引物,其中62对在荔枝上有扩增产物,50对有扩增多态性,即具有一定的通用性。接着从96份荔枝种质中选取12个品种的基因组DNA,开展核心引物筛选,共筛选出多态性较好的EST-SSR分子标记30个;这30个EST-SSR分子标记在96份资源共扩出284条带,不同引物的扩增条带在3～18条之间,平均9.47条,其中有282条为多态性带,多态率高达99.30%,每对引物的Nei's基因多样度范围为0.186～0.396,香农信息指数范围为0.318～0.558;此外,系统聚类分析结果表明,在相似系数0.5525处,可将96份荔枝种质资源分成了8大类群,该8大类群基本与其生态类型和植物学性状特征相符。在此基础上,还对荔枝的主栽品种和特殊种质进行鉴别,结果表明,该30个EST-SSR分子标记在不同品种间可产生较清晰可辨的多态性差异,为荔枝品种以及种质资源鉴别和鉴定的分子指纹的构建奠定了良好基础。
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| 关 键 词： | 荔枝 EST-SSR 种质资源 遗传多样性 |
EST-SSR Analysis of Genetic Diversity in 96 Litchi (Litchi chinensis Sonn.)Germplasm Resources in China |
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| Xiang Xu,Ou Liangxi,Chen Houbin,Sun Qingming,Chen Jiezhen,Cai Changhe,Bai Lijun,Zhao Junsheng.EST-SSR Analysis of Genetic Diversity in 96 Litchi (Litchi chinensis Sonn.)Germplasm Resources in China[J].Genomics and Applied Biology,2010,29(6). |
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| Authors: | Xiang Xu Ou Liangxi Chen Houbin Sun Qingming Chen Jiezhen Cai Changhe Bai Lijun Zhao Junsheng |
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