马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEXL基因的分子特征与表达分析 |
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引用本文: | 范闪闪,郑哲,焦钰,黄荣莲,杜晓东.马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)PmHEXL基因的分子特征与表达分析[J].基因组学与应用生物学,2019,38(2):489-497. |
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作者姓名: | 范闪闪 郑哲 焦钰 黄荣莲 杜晓东 |
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作者单位: | 广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,湛江,524025;广东海洋大学水产学院,湛江,524025;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,湛江,524025 |
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基金项目: | 广东海洋大学创新强校“马氏珠母贝高精度遗传连锁图谱构建与生长性状QTLs的精细定位”;马氏珠母贝海选1号苗种规模化繁育与示范养殖;国家贝类产业体系专项 |
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摘 要: | 几丁质作为有机框架主要成分参与贝壳的形成。β-N-乙酰-己糖胺酶(Beta-hexosaminidase/Beta-N-acetylhexosaminidase, HEX)属于糖苷水解酶家族20,在几丁质水解过程发挥重要作用。为了探究Pm HEXL在马氏珠母贝贝壳形成中的作用,本研究利用RACE技术克隆获得Pm HEXL基因c DNA全长序列并检测其在不同组织的表达模式。研究显示,Pm HEXL基因序列全长2 760 bp,其中5'UTR为167 bp,3'UTR为268 bp,开放阅读框(ORF)为2 325 bp,编码774个氨基酸;预测其相对分子量为89.59 kD,理论等电点为5.93;SMART软件分析PmHEXL蛋白质序列,发现它具有典型的GH20、GH20b结构域和CHB-HEX结构域;多序列比对结果显示Pm HEXL与其它物种的HEX具有较高的保守性;qPCR表达分析显示Pm HEXL在外套膜套膜区表达量最高,边缘区次之。综上所述,Pm HEXL可能参与马氏珠母贝贝壳的形成过程。
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关 键 词: | 马氏珠母贝 β-N-乙酰-己糖胺酶 分子特征 表达分析 |
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