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菠菜性别相关 EST-SSR 标记的开发及应用
引用本文:邓传良*,高俊,曹莹,秦瑞云,高武军,卢龙斗.菠菜性别相关 EST-SSR 标记的开发及应用[J].基因组学与应用生物学,2012,0(5):467-472.
作者姓名:邓传良*  高俊  曹莹  秦瑞云  高武军  卢龙斗
作者单位:河南师范大学生命科学学院, 新乡, 453007
基金项目:国家自然科学基金项目(31000165);河南师范大学校青年骨干教师项目共同资助
摘    要:为了明确菠菜EST序列中SSR的总体特点,开发菠菜EST-SSR引物;为利用EST-SSR引物进行菠菜性别相关特异序列的克隆奠定基础,本文从NCBI上获得1093条EST,利用在线软件SSRIT检测所含SSR序列,并进行分析。共检索出68条SSR序列,分布于64条EST中,检出率为6.22%,包括22种重复基元。其中二核苷酸重复基元的EST-SSR占主导地位,占总SSR数目的32.3%。利用在线引物设计软件Primer3.0设计了7对EST-SSR引物,在适合的PCR反应体系下,分别以雌、雄菠菜DNA基因组为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,结果显示以EST序列HS097148设计的一对引物从菠菜雌雄基因组中扩增出一条雄性特异的条带,表明通过菠菜EST-SSR引物获得菠菜性别相关特异序列是可行的。

关 键 词:菠菜  表达序列标签  微卫星

Development and Application of Sex-Specific EST-SSR Marker in Spinach (Spinacia oleracea L.)
Deng Chuanliang Gao Jun Cao Ying Qin Ruiyun Gao Wujun Lu Longdou.Development and Application of Sex-Specific EST-SSR Marker in Spinach (Spinacia oleracea L.)[J].Genomics and Applied Biology,2012,0(5):467-472.
Authors:Deng Chuanliang Gao Jun Cao Ying Qin Ruiyun Gao Wujun Lu Longdou
Institution:Deng Chuanliang Gao Jun Cao Ying Qin Ruiyun Gao Wujun Lu Longdou College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang, 453007
Abstract:
Keywords:
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