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鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株3'端非编码区序列分析
引用本文:磨美兰,范文胜,黄柏成,郎亚辉,陈秋英,侯金莲,李孟,韦平,韦天超.鸡传染性支气管炎病毒(IBV)广西流行株3'端非编码区序列分析[J].基因组学与应用生物学,2010,29(3).
作者姓名:磨美兰  范文胜  黄柏成  郎亚辉  陈秋英  侯金莲  李孟  韦平  韦天超
作者单位:广西大学动物科学技术学院,南宁,530005
基金项目:国家自然科学基金,广西自然科学基金,广西科技攻关项目,广西高等学校优秀人才资助项目 
摘    要:本研究应用RT-PCR方法扩增出分离自广西的26株鸡传染性支气管炎病毒(IBV)以及参考株M41和疫苗株H120、Ma5和4/91的3'端非编码区(3'UTR)的cDNA,并对其进行了克隆、序列测定、比较及其系统进化分析。序列分析结果表明,与Beaudette株的3'UTR序列相比较,26株分离的IBV中有1株和3株的分离株3'UTR序列分别插入了23个和2个碱基,另外有12株、6株、1株、2株和1株的分离株3'UTR序列分别缺失了1个、2个、22个、29个和84个碱基,不同毒株之间碱基数量最大相差达107个碱基。系统进化分析结果表明,26株分离株可分为4群,其中21株属于第Ⅰ群,与经典疫苗株H120的核苷酸同源性均较低(54.4%~75.5%);3株与4/91同属于第Ⅱ群;1株与H120同属于第Ⅲ群;另外1株单独属于Ⅴ群。综上所述,广西流行IBV的绝大部分毒株在3'UTR序列上与目前常用的疫苗株相比都发生了很大的变异,而且存在多种形式的碱基缺失和插入现象。由此,我们认为流行株的变异可能是疫苗不能提供有效保护的主要原因。

关 键 词:鸡传染性支气管炎病毒  3'端非编码区  系统进化分析  基因缺失  基因插入

Sequence Analysis of 3' Untranslated Region (3'UTR) of Avian Infectious Bronchitis Virus (IBV) Strains Isolated from Guangxi
Mo Meilan,Fan Wensheng,Huang Baicheng,Lang Yahui,Chen Qiuying,Hou Jinlian,Li Meng,Wei Ping,Wei Tianchao.Sequence Analysis of 3' Untranslated Region (3'UTR) of Avian Infectious Bronchitis Virus (IBV) Strains Isolated from Guangxi[J].Genomics and Applied Biology,2010,29(3).
Authors:Mo Meilan  Fan Wensheng  Huang Baicheng  Lang Yahui  Chen Qiuying  Hou Jinlian  Li Meng  Wei Ping  Wei Tianchao
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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