几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析 |
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引用本文: | 巴德仁贵,李爽,王绍萌,马勇,哈斯阿古拉.几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2015(2):382-391. |
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作者姓名: | 巴德仁贵 李爽 王绍萌 马勇 哈斯阿古拉 |
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作者单位: | 内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室 |
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基金项目: | 内蒙古自治区高等学校创新团队发展计划(No.NMGIRT1401)资助 |
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摘 要: | 以拟南芥和蓖麻为重点,利用生物信息学对不同植物的类伐昔洛韦水解酶(valacyclovir hydrolase-like,VACVase-Like)蛋白的理化性质、保守结构域、信号肽、跨膜结构域、导肽、亲疏水性、二级结构及三级结构等进行预测和分析,并构建了该家族系统发生树。结果表明,除了可可树属于稳定蛋白外,其余均属于不稳定蛋白。该基因家族均含有明显的信号肽、导肽、跨膜结构和亲疏水结构,且结构组成上相似,属于分泌蛋白,但是对亚细胞定位分析发现,在不同植物中存在和发挥功能部位均不相同。分析结果可为植物VACVase-like的研究提供有价值的信息,为进一步研究其在植物体内的功能和作用机理提供依据。
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关 键 词: | 伐昔洛韦 类伐昔洛韦水解酶 生物信息学 琢/茁水解酶 |
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