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甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析
引用本文:李旭娟,刘洪博,林秀琴,吴转娣,徐超华,刘新龙.甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2015(1):136-142.
作者姓名:李旭娟  刘洪博  林秀琴  吴转娣  徐超华  刘新龙
作者单位:云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室
基金项目:国家自然科学基金(31360359)资助
摘    要:KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1,Oskn1)为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明:该基因包含一个1 071 bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,分子量为39.36 kD,理论等电点为6.47。该基因很可能定位于细胞核,起转录调控作用,序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等KN1蛋白高度相似。以上分析结果为进一步研究Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。

关 键 词:甘蔗  KNOX基因  电子克隆  生物信息学分析
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