甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 李旭娟,刘洪博,林秀琴,吴转娣,徐超华,刘新龙.甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2015(1):136-142. |
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作者姓名: | 李旭娟 刘洪博 林秀琴 吴转娣 徐超华 刘新龙 |
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作者单位: | 云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31360359)资助 |
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摘 要: | KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1,Oskn1)为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明:该基因包含一个1 071 bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,分子量为39.36 kD,理论等电点为6.47。该基因很可能定位于细胞核,起转录调控作用,序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等KN1蛋白高度相似。以上分析结果为进一步研究Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。
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关 键 词: | 甘蔗 KNOX基因 电子克隆 生物信息学分析 |
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