| 草菇基因组中的tRNA分析 |
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| 引用本文： | 陈炳智,谢宝贵,胡良韬,邓优锦,江玉姬,刘新锐,贵甫.草菇基因组中的tRNA分析[J].基因组学与应用生物学,2013,0(5):594-599. |
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| 作者姓名： | 陈炳智 谢宝贵 胡良韬 邓优锦 江玉姬 刘新锐 贵甫 |
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| 作者单位： | 福建农林大学菌物研究中心，福州，350028 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项资金资助(项目编号：CARS,24) |
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| 摘 要： | 草菇(V olvariella volvacea)，又名中国蘑菇，是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果，分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中，共发现了177个tRNA基因，其中有7个可能的假基因，有2个携带硒代半胱氨酸，一个抑制性tRNA基因和一个未知的异型结构tRNA。除了上述11个特殊的tRNA基因外，166个tRNA可按反密码子类型分成47类。与其它5种担子菌的基因组tRNA比较，草菇的tRNA数量处于第4位，少于鬼伞、裂褶菌、灵芝，多于双孢蘑菇和平菇。通过比较分析草菇及这5种大型真菌的基因组tRNA编码情况，首次报道了几种食用菌tRNA遵守修正的摆动假说的情况。另外，草菇的同功受体tRNA非编码子序列也具有差异性，对tRNA的分析将有助于进一步研究草菇的进化。
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| 关 键 词： | 草菇基因组 tRNA基因 修正的摆动假设 同功受体tRNA |
Analysis of the tRNA Genes in the Volvariella volvacea Genome |
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| Chen Bingzhi
,
Xie Baogui
,
Hu Liangtao
,
Deng Youjin
,
Jiang Yuji
,
Liu Xinrui
,
Gui Fu.Analysis of the tRNA Genes in the Volvariella volvacea Genome[J].Genomics and Applied Biology,2013,0(5):594-599. |
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| Authors: | Chen Bingzhi Xie Baogui Hu Liangtao Deng Youjin Jiang Yuji Liu Xinrui Gui Fu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Volvariella volvacea genome tRNA Modified wobble hypothesis Isoacceptor tRNA |
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