| 蛇足石杉内生真菌Shiraia sp. Slf14全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 范存忠,邱兰兰,吴晓东,杨慧林,张志斌,颜日明,朱笃.蛇足石杉内生真菌Shiraia sp. Slf14全基因组序列分析[J].基因组学与应用生物学,2024(2):353-368. |
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| 作者姓名： | 范存忠 邱兰兰 吴晓东 杨慧林 张志斌 颜日明 朱笃 |
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| 作者单位： | 1. 江西师范大学生命科学学院,江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室;2. 江西科技师范大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32260016)；;江西省教育厅研究生创新基金项目(YC2023-S256)共同资助； |
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| 摘 要： | 内生真菌Shiraia sp. Slf14是从植物蛇足石杉(Huperzia serrata)中分离出来的一株能产生石杉碱甲和竹红菌素A的菌株。为了解菌株Shiraia sp. Slf14的基因特征，对该菌株进行全基因组测序。基于二代测序技术对蛇足石杉内生真菌Shi-raia sp. Slf14的全基因组进行测序分析，通过生物信息学相关软件进行质量控制及组装、功能注释、比较基因组学分析及系统发育分析和次生代谢产物分析。内生真菌Shiraia sp. Slf14的基因组大小为32 067 383 bp, N50的值为525 954 bp, G+C含量为47.96%;预测得到基因组中共有11 242个编码序列(coding sequences, CDS)、 106个tRNA和27个rRNA;在GO、 KEGG、 KOG和CAZY中分别注释到3 822个、 3 223个、 8 837个和563个基因；系统发育结果表明内生真菌Shiraia sp. Slf14属于竹黄菌属(Shiraia)。预测结果表明，内生真菌Shiraia sp. Slf14中存在50个次生代谢产物合成基因簇，具有合成多种...
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| 关 键 词： | 内生真菌 全基因组测序 石杉碱甲 竹红菌素A |
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