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| 洋葱伯克霍尔德氏菌CAS19嗜铁素合成相关基因cepR的克隆及生物信息分析 | |
| 引用本文： | 杨芩,余贤美,贺春萍,郑服丛.洋葱伯克霍尔德氏菌CAS19嗜铁素合成相关基因cepR的克隆及生物信息分析[J].基因组学与应用生物学,2010,29(2). |
| 作者姓名： | 杨芩 余贤美 贺春萍 郑服丛 |
| 作者单位： | 1. 海南大学环境与植物保护学院,儋州,571737;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,热带农业有害生物检测监控中心,儋州,571737 2. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,热带农业有害生物检测监控中心,儋州,571737;山东省果树研究所,泰安,271000 3. 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,热带农业有害生物检测监控中心,儋州,571737;农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室,儋州,571737;海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室,儋州,571737 |
| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资助项目，国家科技支撑计划，公益性行业(农业)科研专项 |
| 摘 要： | 本研究采用PCR方法克隆了洋葱伯克霍尔德氏菌CAS19嗜铁素合成相关基因cepR,并对cepR基因编码蛋白的结构和功能进行生物信息学分析和预测。同源性分析表明,CAS19的cepR核苷酸序列与Burkholderia cepacia LMG1222cepR基因的同源性为99%;cepR基因全长768bp,包含一个完整的231bp的开放阅读框架,编码239个氨基酸;该基因编码蛋白分子量为26.59kD,理论的等电点为5.55,含有一个LuxR型HTH结构域,在氨基酸残基的不同区域分布有酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪氨酸激酶磷酸化位点、N-肉豆蔻酰化位点和N-糖基化位点,还有一个明显的跨膜结构。本研究结果将为洋葱伯克霍尔德氏菌嗜铁素合成相关研究提供调控基因信息和参考依据,并为其进一步开发和利用奠定基础。 |
| 关 键 词： | 洋葱伯克霍尔德氏菌 cepR基因 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of the Siderophore Synthesis-Related Gene CepR from Burkholderia Cepacia CAS19 |
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| Yang Qin,Yu Xianmei,He Chunping,Zheng Fucong.Cloning and Bioinformatic Analysis of the Siderophore Synthesis-Related Gene CepR from Burkholderia Cepacia CAS19[J].Genomics and Applied Biology,2010,29(2). | |
| Authors: | Yang Qin Yu Xianmei He Chunping Zheng Fucong |
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| Keywords: | |
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