| 大鼠Mocs2基因跳跃型外显子可变剪接保留率的检测 |
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| 引用本文： | 李雪,吕达,杨慧楠,王晶妍,高艳荣,邢永强,赵宏宇,蔡禄.大鼠Mocs2基因跳跃型外显子可变剪接保留率的检测[J].基因组学与应用生物学,2021,40(3):1015-1021. |
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| 作者姓名： | 李雪 吕达 杨慧楠 王晶妍 高艳荣 邢永强 赵宏宇 蔡禄 |
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| 作者单位： | 内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头,014010;内蒙古科技大学生命科学与技术学院,包头,014010;内蒙古科技大学,内蒙古自治区功能基因组生物信息学重点实验室,包头,014010;包头医学院公共卫生学院,包头,014010 |
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| 摘 要： | 可变剪接是真核生物基因表达调控的一种重要方式,它通过剪接位点调控ORFs (Open reading frames)区域外显子或内含子的表达,产生不同的mRNA剪接体,进一步翻译成具有相同或不同功能的蛋白质,从而对诸如发育、疾病、环境响应等生物学过程产生重要影响.已有文献报道,人类Mocs2基因exon 1a与exon 1b外显子发生互斥型可变剪接,产生的两个剪接体分别编码钼喋呤合酶的大小亚基,参与钼辅因子生物的合成过程.基于本课题组前期大鼠肺部组织RNA-seq测序的结果,发现Mocs2基因2号外显子转录后可被剪接或保留,产生两个不同的剪接体.为验证测序结果的准确性,本研究利用半定量PCR与实时荧光定量PCR两种方法检测大鼠脑、海马、肺组织中Mocs2基因2号外显子的保留率.半定量PCR方法检测大鼠肺、海马、大脑组织中Mocs2基因的保留率分别为(88.28±3.09)％、(99.44±0.24)％、(99.54±0.19)％.实时荧光定量PCR检测的保留率分别为(66.76±20.47)％、(75.60±12.44)％、(87.28±16.4)％.实验结果表明,Mocs2基因2号外显子在大鼠中存在可变剪接现象,且不同组织具有一定差异.本工作进一步验证了两种PCR方法检测前体mRNA可变剪接保留率的可行性.
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| 关 键 词： | 可变剪接 半定量PCR 实时荧光定量PCR 保留率 Mocs2基因 |
Detection of Alternative Splicing Exon Inclusive Ratio of Exon 2 of Mocs2 Gene in Rat |
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| Li Xue,Lü Da,Yang Huinan,Wang Jingyan,Gao Yanrong,Xing Yongqiang,Zhao Hongyu,Cai Lu.Detection of Alternative Splicing Exon Inclusive Ratio of Exon 2 of Mocs2 Gene in Rat[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(3):1015-1021. |
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| Authors: | Li Xue Lü Da Yang Huinan Wang Jingyan Gao Yanrong Xing Yongqiang Zhao Hongyu Cai Lu |
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