| 薏苡黑穗病菌的宏基因组测序及分类解析 |
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| 引用本文： | 李祥栋,潘虹,陆秀娟,魏心元,陆平,石明,练启仙,付瑜华.薏苡黑穗病菌的宏基因组测序及分类解析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):270-278. |
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| 作者姓名： | 李祥栋 潘虹 陆秀娟 魏心元 陆平 石明 练启仙 付瑜华 |
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| 作者单位： | 贵州省薏苡工程技术研究中心,兴义,562400;贵州黔西南喀斯特区域发展研究院,兴义,562400;中国农科院作物研究所,北京,100081;贵州省薏苡工程技术研究中心,兴义,562400;兴义民族师范学院,兴义,562400;贵州省农业科学院亚热带作物研究所,兴义,562400 |
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| 摘 要： | 旨在寻找薏苡黑穗病害的关键致病菌群,指导薏苡的黑穗病害防治.本研究利用ITS高通量测序技术对薏苡的黑穗病瘿的真菌进行检测,解析薏苡黑穗病瘿组织的菌群组成和群落多样性.结果表明,薏苡黑穗病瘿中存在多种真菌菌群,总共聚类得到2 699条物种OTU,所有样品共同拥有94条,总共注释得到9门、19纲、37目、68科和85属.在属分类水平发现2个与黑穗病相关的近缘真菌属Sporisorium和Ustilago,其中Sporisorium为优势菌群.3份样品Shannon多样性指数物种大小为XY-2＞XY-3＞XY-1,且XY-1和XY-3的菌群组成更为相似.本研究结果对于薏苡黑穗病菌的分离鉴定和绿色防控具有重要指导意义.
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| 关 键 词： | 宏基因组 ITS 黑穗病 分类 薏苡 |
Meta genomic Sequencing and Taxonomic Analysis of Smut Fungus in Job's Tears |
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| Li Xiangdong,Pan Hong,Lu Xiujuan,Wei Xinyuan,Lu Ping,Shi Ming,Lian Qixian,Fu Yuhua.Meta genomic Sequencing and Taxonomic Analysis of Smut Fungus in Job's Tears[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(1):270-278. |
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| Authors: | Li Xiangdong Pan Hong Lu Xiujuan Wei Xinyuan Lu Ping Shi Ming Lian Qixian Fu Yuhua |
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