温室白粉虱触角miRNA转录组分析及调控嗅觉相关基因miRNA的鉴定 |
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引用本文: | 杨晓洁,廖世群,刘映杨,蔡赛波,李宏伟,林连兵,张棋麟.温室白粉虱触角miRNA转录组分析及调控嗅觉相关基因miRNA的鉴定[J].基因组学与应用生物学,2021,40(1):51-59. |
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作者姓名: | 杨晓洁 廖世群 刘映杨 蔡赛波 李宏伟 林连兵 张棋麟 |
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作者单位: | 昆明理工大学生命科学与技术学院,昆明,650500;云南省高校饲用抗生素替代技术工程研究中心,昆明,650500 |
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摘 要: | microRNA(miRNA)是一类真核生物中内源性的非编码小RNA,在基因转录后水平调控靶基因的小分子.温室白粉虱(Trialeurodes vaporariorum)是一种危害多种蔬菜、花卉及农作物等的世界性害虫,可以导致植物细菌性病害的传播和流行,其触角对温室白粉虱的取食、行为和生长发育等起到了重要作用.本研究以温室白粉虱成虫触角为材料,通过Illumina高通量测序平台对其miRNA转录组进行测序,结合生物信息学分析,鉴定到83个已知miRNAs和38个新miRNA(novel_mirs),并对它们表达水平进行定量分析.此外,对已知miRNA种子序列碱基编辑情况进行了调查.最后,利用生物信息学工具对miRNAs进行靶基因预测和功能注释,获得了 miRNA-靶基因关系及调控嗅觉相关基因的miRNAs.本研究为深入探讨温室白粉虱触角miRNA中嗅觉相关基因的调控关系,了解昆虫嗅觉形成的分子机制提供了参考.
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关 键 词: | 温室白粉虱 触角miRNA转录组 高通量测序 嗅觉相关基因 |
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