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雷州地区马尾藻系统进化分析
引用本文:沈城,徐秀菊,陈庆鑫,武艳丽,张艳苹,刘丽.雷州地区马尾藻系统进化分析[J].基因组学与应用生物学,2021,40(4):1801-1810.
作者姓名:沈城  徐秀菊  陈庆鑫  武艳丽  张艳苹  刘丽
作者单位:广东徐闻珊瑚礁国家级自然保护区管理局,徐闻,524100;广东海洋大学水产学院,湛江,524088;河北省水产良种与渔业环境检测保护总站,石家庄,050000
摘    要:通过PCR扩增测序及种间比对,对获得的6种马尾藻18SrRNA、COI和ITS基因部分同源序列进行分析,结果显示:(1)18S rRNA基因同源序列长度为1 673 bp,其中保守位点1 668个,可变位点3个,简约信息位点1个,单变异多态位点2个;T、C、A、G的平均含量分别为26.4%、21.4%、24.4%、27.8%.(2)COI同源序列长度为643 bp,其中保守位点567个,可变位点76个,简约信息位点28个,单变异多态位点47个;T、C、A、G的平均含量分别为40.0%、17.6%、19.1%、23.3%.(3)ITS同源序列长度为1 539 bp,其中保守位点1 272个,可变位点193个,简约信息位点55个,单变异多态位点138个;T、C、A、G的平均含量分别为23.5%、26.5%、17.1%、32.9%.(4)基于Kimnra双参数模型计算遗传距离,选用褐藻纲部分物种为外源,构建18S rRNA,COI和ITS基因序列系统发育树.用COI和ITS基因构建的发育树与利用形态学进行的分类较为一致,真马尾藻亚属(Sargassum)的张氏马尾藻(Sargassum zhangii)、全缘马尾藻(Sargassum integerrimum)、匍枝马尾藻(Sargassum polycystum)、亨氏马尾藻(Sargassum henslowianum)、灰叶马尾藻(Sargassum cinereum)亲缘关系较近,先聚为一支,再与反曲叶亚属的半叶马尾藻(Sargassum hemiphyllum)聚为一支,然后与其他亚属的聚为一大支;而用18S rRNA基因构建的发育树中,亨氏马尾藻先与半叶马尾藻聚为一支,后与真马尾藻亚属的聚为一支,最后与其他亚属的聚为一大支.从序列的保守度分析,18SrRNA基因具有高度保守性,可用于属以上单元鉴别分类;COI和ITS基因多态性较高,可用于种间分类.

关 键 词:马尾藻  18S  rRNA基因  COI  ITS  系统进化分析

Phylogenetic Analysis of Sargassum in Leizhou Peninsula
Shen Cheng,Xu Xiuju,Chen Qingxin,Wu Yanli,Zhang Yanping,Liu Li.Phylogenetic Analysis of Sargassum in Leizhou Peninsula[J].Genomics and Applied Biology,2021,40(4):1801-1810.
Authors:Shen Cheng  Xu Xiuju  Chen Qingxin  Wu Yanli  Zhang Yanping  Liu Li
Abstract:
Keywords:
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