山羊KRTAP26-1基因鉴定及其遗传特征研究 |
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引用本文: | 车陇杰,王继卿,Huitong Zhou,李涛,赵孟丽,胡江,刘秀,李少斌,罗玉柱.山羊KRTAP26-1基因鉴定及其遗传特征研究[J].基因组学与应用生物学,2018(2). |
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作者姓名: | 车陇杰 王继卿 Huitong Zhou 李涛 赵孟丽 胡江 刘秀 李少斌 罗玉柱 |
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作者单位: | 甘肃农业大学动物科学技术学院;甘肃省草食动物生物技术重点实验室;国际毛绒研究所;林肯大学农业与生命科学学院; |
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摘 要: | 角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)是羊毛和羊绒的主要结构成分,决定了它们的理化性质。在人类、家犬、小鼠和大鼠中已描述了高硫蛋白KAP26-1的编码基因,但在山羊中该基因尚未被鉴定。本研究以人类KRTAP26-1基因编码区序列为模板,利用BLAST软件,在山羊基因组中发现了与人类KRTAP26-1基因具有高度同源性的序列并被假定为山羊的KRTAP26-1基因。PCR-SSCP分析发现,在5个山羊群体的605个个体中有4条不同的核苷酸变异序列(定义为A~D)。序列同源性和进化树研究结果表明,这4条序列与已鉴定的其它山羊KRTAPs基因序列有较低的同源性,但与人类、家犬、小鼠和大鼠的KR-TAP26-1基因序列具有最高的同源性。这说明发现的这4条序列是山羊KRTAP26-1基因的等位基因。4个等位基因的编码区内,共发现了6个SNPs位点,其中3个是非同义突变,造成了氨基酸序列的变化。4条多肽链含有36~38个磷酸化位点。5个山羊群体均处于中度多态,但是等位基因频率分布在不同群体间有差异。等位基因A、B和D在5个山羊群体中均出现,但C在中卫山羊中没有出现。结果表明,山羊KR-TAP26-1基因有较为丰富的核苷酸序列变异,这些变异可能与绒山羊的产绒性能有关。
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