烟草黑胫病胁迫相关miRNA鉴定及功能分析 |
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引用本文: | 黄飞燕,叶贤文,王戈,何晓健,张柳,杨焕文.烟草黑胫病胁迫相关miRNA鉴定及功能分析[J].基因组学与应用生物学,2018(1). |
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作者姓名: | 黄飞燕 叶贤文 王戈 何晓健 张柳 杨焕文 |
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作者单位: | 云南农业大学农学与生物技术学院;云南省烟草公司昆明市公司安宁分公司;云南农业大学烟草学院;红云红河烟草(集团)有限责任公司; |
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摘 要: | MicroRNAs是一类非编码RNA分子,通过RNA沉默在转录后水平调控基因表达,在响应非生物和生物胁迫中扮演重要角色。本研究为了阐明烟草黑胫病抗病分子机制,构建了抗病品种云87接菌前0 h和接菌后12 h、24 h、48 h和72 h茎部组织的5个小RNA文库。运用solexa高通量测序技术鉴定出565个已知miRNAs(代表63个miRNA家族)和187个新miRNAs。在黑胫病菌胁迫下,总共有156个miRNA差异表达,大部分差异表达miRNA聚类到profile 18、profile 15和profile 9等3种显著性动态表达模式,并用qRT-PCR方法验证部分差异表达miRNA表达模式。靶基因预测和功能分析表明,差异表达miRNA主要参与调控防御响应、转录因子或信号级联途径和不同生理过程相关基因表达。本研究初步揭示了烟草与黑胫病非亲和互作间在转录后水平上的调控机制,为培育抗黑胫病烟草品种提供miRNA水平的理论依据。
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