番茄AS2基因家族的系统进化分析 |
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引用本文: | 刘洋,郑洋洋,宫超,程谟桢,黄海峰,张瑶,陈秀玲,王傲雪.番茄AS2基因家族的系统进化分析[J].基因组学与应用生物学,2018(9). |
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作者姓名: | 刘洋 郑洋洋 宫超 程谟桢 黄海峰 张瑶 陈秀玲 王傲雪 |
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作者单位: | 东北农业大学生命科学学院;东北农业大学园艺学院 |
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摘 要: | AS2基因家族是一类直接参与转录调控并广泛存在于植物中的转录因子家族,能够调控植物生长发育和抗逆境胁迫过程。本研究通过分析番茄基因组,鉴定了番茄中具有特定结构域的AS2基因,并利用生物信息学手段对番茄AS2基因的系统进化、染色体定位以及基因结构等信息进行了分析。系统进化分析共鉴定了45个番茄AS2基因家族成员,分成5个亚类。亚细胞定位分析表明,该家族基因主要分布在细胞核上。染色体定位揭示了AS2基因分布于10条染色体上,基因主要以片段复制的方式进行扩增。本研究为进一步探究番茄和其他物种中AS2基因功能奠定了基础。
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