拟南芥ATGs在发育和非生物胁迫中的表达特征和功能分析 |
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引用本文: | 张鸿哲,朱璐,左泽远,刘文浩,许杰.拟南芥ATGs在发育和非生物胁迫中的表达特征和功能分析[J].基因组学与应用生物学,2020,39(6):2671-2682. |
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作者姓名: | 张鸿哲 朱璐 左泽远 刘文浩 许杰 |
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作者单位: | 上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240;上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240;上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240;上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240;上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240 |
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基金项目: | 本研究由国家自然科学基金项目 |
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摘 要: | 植物细胞自噬(Autophagy)是依赖于液泡来降解体内异常蛋白的重要途径,其中ATGs (Autophagyrelated genes)蛋白对该途径中的核心组分自噬体的形成至关重要。目前在模式植物拟南芥中已经鉴定到35个ATGs,它们对细胞自噬的发生和调节起到关键作用,然而全面地认知植物ATGs在生长发育和逆境中的转录表达变化尚有不足。本研究通过收集公共数据库中的转录组数据,利用生物信息学方法挖掘了拟南芥ATGs的表达信息,展示了其在47个不同发育时期或组织部位的表达聚类情况,对比分析了ATGs在植物非生物胁迫情况下的地上部分(茎)和地下部分(根)的表达差异,同时结合ATGs的启动子组分分析,阐明ATGs表达的时空变化可能的调控分子机制。本研究将为进一步探索ATGs在生长发育和非生物胁迫中的功能提供基础数据和相关依据。
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关 键 词: | 自噬相关基因(ATGs) 表达模式 生长发育 非生物胁迫 |
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