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肠杆菌属细菌一类整合子及其基因盒特征
引用本文:熊明华,朱继荣,杨芮,汪淑玉,臧娜娜,王昊,李峰.肠杆菌属细菌一类整合子及其基因盒特征[J].基因组学与应用生物学,2020,39(5):2079-2087.
作者姓名:熊明华  朱继荣  杨芮  汪淑玉  臧娜娜  王昊  李峰
作者单位:淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000;淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000;淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000;淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000;淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000;淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000;淮北师范大学生命科学学院,淮北,235000
基金项目:国家自然科学基金项目;安徽高校科研平台创新团队项目;本研究由安徽省教育厅高校自然科学研究项目;安徽省自然科学基金项目
摘    要:整合子是捕获、整合和表达外源基因的重要元件,可以加速抗生素抗性基因的传播。本研究分析了已完成全基因组测序肠杆菌属细菌一类整合子及其基因盒的存在情况与特征。实验表明,目前62个肠杆菌属细菌,包括40个阴沟肠杆菌、11个霍氏肠杆菌和11个其它肠杆菌都完成了全基因组测序,其中40.32%(25/62)肠杆菌属细菌含有一类整合子。在25个含一类整合子的肠杆菌中,72%(18/25)携带一个整合子,28%(7/25)含有多个整合子。25个肠杆菌共存在36个整合子,其中88.89%(32/36)位于质粒上,其余11.11%(4/36)位于染色体上。肠杆菌属细菌一类整合子整合酶基因(1 014 bp)高度保守,其中一个整合子整合酶基因发生了3碱基突变(3/1 014),7个发生2碱基突变(2/1 014),13个发生1碱基突变(1/1 014 bp),其余没有突变。25个含一类整合子肠杆菌共存在18种基因盒,其中dfrA1基因盒频率最高16.13%(10/62),其次是aadA1(8.06%, 5/62),接着是aacA27-ereA-IS1247-aac3-arr2-ereA基因盒(4.84%, 3/62),其他基因盒频率低于4.0%。本研究有助于了解一类整合子在肠杆菌属细菌产生抗生素抗药性中的重要作用。

关 键 词:一类整合子  基因盒  肠杆菌属细菌
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