牛MA GEL2的基因结构及在组织和胎盘中印记状态分析 |
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引用本文: | 陈玮娜,马超,李瑾,张层层,李若梅,李世杰.牛MA GEL2的基因结构及在组织和胎盘中印记状态分析[J].基因组学与应用生物学,2020,39(5):2006-2013. |
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作者姓名: | 陈玮娜 马超 李瑾 张层层 李若梅 李世杰 |
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作者单位: | 河北农业大学生命科学学院,保定,071001;河北大学中医学院,保定,071000;保定市第二医院,保定,071000;河北农业大学生命科学学院,保定,071001 |
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基金项目: | 河北省自然科学基因项目;国家自然科学基金 |
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摘 要: | 本研究旨在揭示牛PWS/AS (Prader-willi syndrome/angelman syndrome)印记区域中的MAGEL2 (Melanoma antigen-like gene 2)基因的结构特点及其在成年牛组织及胎盘中的印记状态。生物信息学软件分析发现,牛MAGEL2基因位于21号染色体,为单外显子蛋白编码基因,编码长为1 183个氨基酸的多肽序列,其产物为MAGE家族成员之一。构建MAGEL2基因的进化树,发现牛MAGEL2基因与羊相似性最高。MAGEL2在不同物种之间具有较高的保守性。应用基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)的RTPCR产物直接测序的方法分析MAGEL2在牛8个组织和器官(心,肝,脾,肺,肾,肌肉,脂肪和大脑)及胎盘的印记状态。比较杂合牛基因组PCR产物和RT-PCR产物在SNP位点的测序结果发现,MAGEL2基因在成年牛组织及胎盘中均为单等位表达,提示MAGEL2基因在牛中是印记的。
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关 键 词: | 牛 MA GEL2 基因结构 印记状态 SNP |
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