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普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的生物信息和表达分析
引用本文:张凤洁,李雪垠,高世庆,唐益苗,王爱萍.普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的生物信息和表达分析[J].植物遗传资源学报,2014,15(5):1012-1022.
作者姓名:张凤洁  李雪垠  高世庆  唐益苗  王爱萍
作者单位:山西农业大学农学院,西北农林科技大学农学院,北京杂交小麦工程技术研究中心,北京杂交小麦工程技术研究中心,山西农业大学农学院
基金项目:山西省科技攻关计划项目(20120311001-1);国家自然基金(31201200);北京市农林科学院国际合作项目(GJHZ2013)
摘    要:采用生物信息学方法,利用核酸、蛋白数据库对普通小麦祖先种乌拉尔图小麦(Triticum urartu L.)和粗山羊草(Aegilops tauschii L.)NAC转录因子基因家族进行分析,分别鉴定出107、126个NAC蛋白家族成员。根据拟南芥、水稻NAC基因家族分类系统,将其分为15个亚族。通过与抗逆相关基因TaNAC2a进行同源进化树分析,发现5个TuNAC、6个AetNAC基因与其高度同源,对这些基因的蛋白结构域、基因结构、启动子顺式作用元件及组织表达特性进行分析。结果表明,11个NAC蛋白具有典型的NAC结构域。进化关系较近的基因具有相似基因结构;启动子区域预测发现其均含有逆境胁迫响应作用元件。实时荧光定量PCR结果显示,TuNAC、AetNAC基因分别在乌拉尔图小麦和粗山羊草根、胚芽鞘、叶组织中均有表达,并呈现出明显的组织表达特异性。通过芯片表达数据和逆境胁迫基因表达试验,推测AetNAC2c基因可能参与植物干旱胁迫响应,AetNAC2b可能参与调控植物的耐旱、耐低温胁迫反应。上述分析结果为普通小麦祖先种基因家族的系统研究,优异候选功能基因的预测、筛选提供了试验依据。

关 键 词:乌拉尔图小麦  粗山羊草  NAC  生物信息学  表达特性
收稿时间:2014/4/28 0:00:00
修稿时间:2014/5/29 0:00:00
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