黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析

以黄瓜(Cucumis sativus L.)嫩果皮绿色自交系1613(P1)和嫩果皮白色自交系JD7(P2)为试验材料构建重组自交系(RIL)群体(142个株系),对各株系嫩果皮色进行表型鉴定,利用重测序技术对各自交系进行基因分型,结合表型和基因型数据进行QTL定位研究。结果表明F1黄瓜嫩果皮颜色表现为绿色,并将控制嫩果皮颜色的基因定位到黄瓜第3号染色体上,在3号染色体35511129~39711114区段内定位到成簇分布的3个位点,它们在连锁图谱上的位置分别为1. 01 c M、3. 31 c M和6. 01 c M处,与两翼标记的连锁距离分别为1. 01 c M/0. 09 c M,0. 21 c M/0. 29 c M,0. 11 c M/0. 19 c M。通过生物信息学分析预测出16个候选基因,其中Csa3G904080、Csa3G904100、Csa3G903500和Csa3G902950极有可能是调控黄瓜果实颜色的关键基因。