| 谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 赵艳,瓮巧云,马海莲,宋晋辉,袁进成,王凌云,董志平,刘颖慧.谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析[J].植物遗传资源学报,2016,17(3):547-554. |
| |
| 作者姓名： | 赵艳 瓮巧云 马海莲 宋晋辉 袁进成 王凌云 董志平 刘颖慧 |
| |
| 作者单位： | 1. 河北北方学院,张家口,075000;2. 河北省农林科学院谷子研究所,石家庄,050001 |
| |
| 基金项目： | 国家科技重大专项(2014ZX0800909B)，河北省高等学科拔尖人才选拔与培养计划(BRZ-234)，河北北方学院重大项目(ZD201305)，河北北方学院作物学重点实验室 |
| |
| 摘 要： | 生长素应答因子(ARF,auxin response factors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的生长发育中起至关重要的作用。本研究以谷子为材料,共鉴定出24个ARF基因,命名为Si ARFs。利用生物信息学对谷子Si ARFs基因的结构、染色体分布、基因倍增模式、系统进化以及基因的表达模式进行分析。结果表明,Si ARF基因家族在染色体上呈不均匀分布,除2号染色体外,其他染色体上都有该家族基因,基因的扩增模式为分散复制与片段复制。Si ARFs基因家族具有相对保守的结构,即包含1个保守的B3 DNA结构域、ARF结构域和Aux/IAA结构域,ARF蛋白的3D结构含有3个α螺旋和7个β折叠结构。进化树分析表明谷子ARF蛋白和物种相近的高粱、玉米聚在一起。大多数ARF基因在谷子根、茎、叶和穗中都有表达,且不同基因表达量有较大差异。
|
| 关 键 词： | 谷子 ARF 生物信息学分析 蛋白结构 |
| 收稿时间： | 2015/6/30 0:00:00 |
| 修稿时间： | 7/6/2015 12:00:00 AM |
Genome-Wide Identification and Bioinformatics Analysis of ARF Gene Family in Setaria Italica |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | setaria italica ARF information analysis protein structure |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《植物遗传资源学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《植物遗传资源学报》下载免费的PDF全文 |
|
