| 甘蓝型油菜籽粒着生密度及其相关性状全基因组关联分析 |
| |
| 引用本文： | 任义英,崔翠,王倩,徐新福,林呐,殷家明,唐章林,李加纳,周清元.甘蓝型油菜籽粒着生密度及其相关性状全基因组关联分析[J].植物遗传资源学报,2018,19(2):314-325. |
| |
| 作者姓名： | 任义英 崔翠 王倩 徐新福 林呐 殷家明 唐章林 李加纳 周清元 |
| |
| 作者单位： | 西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院,西南大学农学与生物科技学院 |
| |
| 基金项目： | 国家科技支撑项目（2013BAD01B03-12）；国家农业部现代农业产业技术体系（CARS-12）；重庆市社会事业与民生保障科技创新（cstc2016shmszx0756）；西南大学博士启动基金（swu113064） |
| |
| 摘 要： | 油菜角果内籽粒着生密度影响每果粒数,对油菜产量有直接或间接影响。本研究以不同遗传背景和地理来源的213份甘蓝型油菜品种(系)构成的自然群体为研究对象,利用芸薹属60 K Illumina Infinium SNP芯片进行群体结构、亲缘关系以及连锁不平衡分析;然后基于最优模型对籽粒着生密度及其相关性状进行全基因组关联(GWAS)分析。通过GWAS分析,共检测到10个SNP位点与籽粒着生密度及其相关性状关联。其中与籽粒着生密度关联的标记有2个,表型贡献率分别为9.49%和11.17%;与角果有效长关联的标记有6个,单个位点可解释9.81%~12.17%的表型变异;与每果粒数相关联的标记有2个,分别解释10.44%和10.87%的表型变异。通过分析关联SNP位点的LD区间的基因信息,筛选出16个与籽粒着生密度及其相关性状有关的候选基因,其中KMD4和UGT76C2基因与细胞分裂素的调控有关;AGL104和ADC2基因参与种子的形成过程;MCCB、NGA2和MATE等基因参与侧生器官的生长发育过程,它们的异常表达会导致一些侧生器官的变异。ADC2和UGT76C2两个候选基因可能对籽粒着生密度和每果粒数一因多效性。
|
| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 籽粒着生密度 连锁不平衡 基因组关联分析 |
| 收稿时间： | 2017/9/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/1/29 0:00:00 |
Genome-wide association analysis of silique density of seed density within per silique and its related traits in Brassica napus L. |
| |
| Zhou Qingyuan.Genome-wide association analysis of silique density of seed density within per silique and its related traits in Brassica napus L.[J].Journal of Plant Genetic Resources,2018,19(2):314-325. |
| |
| Authors: | Zhou Qingyuan |
| |
| Institution: | South West University |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Brassica napus Seed density within per silique linkage disequilibrium Genome-wide association analysis |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《植物遗传资源学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《植物遗传资源学报》下载免费的PDF全文 |
|
