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苦荞SSR引物开发及其在遗传多样性分析中的应用
引用本文:韩瑞霞,张宗文,吴 斌,李艳琴.苦荞SSR引物开发及其在遗传多样性分析中的应用[J].植物遗传资源学报,2012,13(5):759-764.
作者姓名:韩瑞霞  张宗文  吴 斌  李艳琴
作者单位:1. 山西大学生物技术研究所,太原030006;中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
2. 中国农业科学院作物科学研究所,北京100081;国际生物多样性中心东亚办事处,北京100081
3. 中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081
4. 山西大学生物技术研究所,太原,030006
基金项目:国际生物多样性中心与中国农业科学院作物科学研究所合作项目((No. APO2009/004))
摘    要:苦荞在中国已经成为广受欢迎的健康食品。本研究通过选择性扩增微卫星序列、体外重组扩增产物和构建SSR富集文库,开发出了一种简便的重组微卫星引物设计方法。通过这种方法,设计合成500对SSR引物,在苦荞上的有效性约50%,多态率达10.8%,PIC平均值为0.3600。利用其中的28对SSR引物,在苦荞核心种质中检测出等位基因85个,每位点的等位基因数为2~5个,平均3.0个。不同地理来源的苦荞种质资源的Shannon-Weaver多样性指数为0.3633~0.6671,来自云南、四川和西藏的苦荞材料不但遗传多样性丰富,而且亲缘关系较近,进一步证实苦荞起源于中国西南部。本研究证明重组微卫星引物设计方法开发的引物对苦荞非常有效,将有助于促进苦荞种质资源遗传多样性、有用基因发掘和分子标记辅助育种研究。

关 键 词:苦荞  SSR标记  遗传多样性
收稿时间:3/23/2012 1:53:18 PM
修稿时间:6/16/2012 8:59:03 AM

Development of SSR Markers and Application in Analysis of Genetic Diversity in Tartary Buckwheat (Fagopyrum tataricum)
HanRuixi,Wubin,Zhangzongwen and Liyanqin.Development of SSR Markers and Application in Analysis of Genetic Diversity in Tartary Buckwheat (Fagopyrum tataricum)[J].Journal of Plant Genetic Resources,2012,13(5):759-764.
Authors:HanRuixi  Wubin  Zhangzongwen and Liyanqin
Institution:1(1 Institute of Biotechnology,Shanxi University,Taiyuan 030006;2 Institute of Crop Science of Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081;3 Bioversity International,Office for East Asia,Beijing 100081)
Abstract:
Keywords:tartary buckwheat  SSR markers  genetic diversity
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