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沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式
引用本文:赵晓鑫,刘美芹,师静,智冠华,刘胜利,张俊琦,卢存福.沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式[J].植物遗传资源学报,2013,14(3):492-500.
作者姓名:赵晓鑫  刘美芹  师静  智冠华  刘胜利  张俊琦  卢存福
作者单位:北京林业大学,北京林业大学,北京林业大学,北京林业大学,北京林业大学,北京林业大学,北京林业大学
基金项目:国家自然科学基金项目(面上项目,重点项目,重大项目)
摘    要:本文对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行分子特性和表达模式分析,生物信息学分析表明该基因编码一种第5族胚胎晚期发生丰富蛋白(LEA)。AmLEA5基因全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测AmLEA5的分子量为10.6 kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点。密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子。系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高。亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内。一系列实验结果说明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用。

关 键 词:沙冬青  AmLEA5  生物信息学分析  表达模式  亚细胞定位
收稿时间:2012/10/26 0:00:00
修稿时间:2013/1/10 0:00:00

Characterization and expression patterns under abiotic stresses of AmLEA5 from Ammopiptanthus mongolicus
zhaoxiaoxin,liumeiqin,shijing,zhiguanhu,liushengli,zhangjunqi and lucunfu.Characterization and expression patterns under abiotic stresses of AmLEA5 from Ammopiptanthus mongolicus[J].Journal of Plant Genetic Resources,2013,14(3):492-500.
Authors:zhaoxiaoxin  liumeiqin  shijing  zhiguanhu  liushengli  zhangjunqi and lucunfu
Institution:Beijing Forestry University,Beijing Forestry University,Beijing Forestry University,Beijing Forestry University,Beijing Forestry University,Beijing Forestry University,Beijing Forestry University
Abstract:
Keywords:Ammopiptanthus mongolicus  AmLEA5  Bioinformatic analysis  Expression pattern  Subcellular localization
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