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萝卜全基因组中LBD基因家族成员的鉴定与分析
引用本文:刘同金,张晓雪,张晓辉,王海平,邱杨,宋江萍,李锡香.萝卜全基因组中LBD基因家族成员的鉴定与分析[J].植物遗传资源学报,2019(1):168-178.
作者姓名:刘同金  张晓雪  张晓辉  王海平  邱杨  宋江萍  李锡香
作者单位:中国农业科学院蔬菜花卉研究所/农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室
基金项目:"十三五"国家重点研发计划课题(2016YFD0100204-2);中国博士后科学基金项目(2017M620971);国家科技资源共享服务平台(NICGR2018-15);农作物种质资源保护项目;中国农业科学院科技创新工程协同创新任务(CAAS-XTCX2016016-4-4;CAASXTCX2016001-5-2;CAAS-XTCX2016017)~~
摘    要:LBD基因家族是植物所特有的一类转录因子,在植物生长发育过程中起到非常重要的作用。本研究利用生物信息学方法,从萝卜基因组中鉴定出分布于9条染色体上的59个LBD基因。该家族成员结构比较简单,内含子数均不超过3个。萝卜LBD基因可分为两大类,分别包含50个和9个成员。它们在染色体上的分布不均匀,1号染色体上基因数目最多,有18个,而7号和8号染色体分别仅有1个LBD基因。对它们在不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性,预测其参与萝卜不同的发育过程。本研究为萝卜LBD基因家族的功能分析奠定了基础。

关 键 词:萝卜  LBD基因家族  系统进化  基因表达

Genome-wide Characterization of the LBD Gene Family in Radish
LIU Tong-jin,ZHANG Xiao-xue,ZHANG Xiao-hui,WANG Hai-ping,QIU Yang,SONG Jiang-ping,LI Xi-xiang.Genome-wide Characterization of the LBD Gene Family in Radish[J].Journal of Plant Genetic Resources,2019(1):168-178.
Authors:LIU Tong-jin  ZHANG Xiao-xue  ZHANG Xiao-hui  WANG Hai-ping  QIU Yang  SONG Jiang-ping  LI Xi-xiang
Institution:(Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops,Ministry of Agriculture,Beijing 100081)
Abstract:LIU Tong-jin;ZHANG Xiao-xue;ZHANG Xiao-hui;WANG Hai-ping;QIU Yang;SONG Jiang-ping;LI Xi-xiang(Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops,Ministry of Agriculture,Beijing 100081)
Keywords:radish  LBD gene family  phylogenetic evolution  expression profile
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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