| 水稻内颖畸形或缺失基因OsAPP1的图位克隆及表达分析 |
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| 引用本文： | 陈晓东,李飞,李丹阳,刘灵芝,乔守晨,孙红正,李俊周,张静,彭廷,谭金芳,杜彦修,赵全志.水稻内颖畸形或缺失基因OsAPP1的图位克隆及表达分析[J].植物遗传资源学报,2021(2):416-426. |
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| 作者姓名： | 陈晓东 李飞 李丹阳 刘灵芝 乔守晨 孙红正 李俊周 张静 彭廷 谭金芳 杜彦修 赵全志 |
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| 作者单位： | 河南农业大学农学院/河南省水稻生物学重点实验室;中山大学农学院 |
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| 基金项目： | 河南省水稻产业技术体系项目(S2012-04-02)。 |
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| 摘 要： | 在育种基地材料中发现一株内颖畸形或缺失(abnormal or absent palea)突变体,将其命名为app1。该突变体在营养生长时期发育正常,但抽穗后突变体表现出内颖畸形(比外稃短导致颖壳不闭合,或者出现两个内稃)或缺失,其花粉育性为55.52%,结实率为6.48%,千粒重为10.811 g,种子发芽率为55.21%。以突变体app1与日本晴杂交构建了F1和F2群体,F1颖壳表型正常,F2群体出现内颖畸形和正常表型分离,内颖正常和突变表型分离比例为3∶1,表明app1内颖突变表型由单隐性核基因控制。以F2为分离群体,将app1精细定位于第3染色体上,位于分子标记ID4231和ID4246之间,遗传距离1.3 cM,对应物理距离为13.2 kb。该区段内完全包含1个开放阅读框,包含两个部分开放阅读框,经过测序分析发现候选基因LOC_Os03g11614启动子区发生点突变和245 bp缺失,qRT-PCR分析证实LOC_Os03g11614为OsAPP1基因。已有报道LOC_Os03g11614编码OsMADS1,是调控水稻花器官发育的重要明星基因,其不同位置的突变可以导致叶状颖壳和不育、以及控制籽粒大小。与3000份水稻种子资源SNP/Indel变异类型对比分析发现,突变体app1启动子的突变完全不同于现已OsMADS1研究报道突变类型,且与数据库中的自然突变类型多数不同。因此,本研究发现的app1突变体,是以往报道中从未出现的OsMADS1启动子发生突变的新型突变,且该类突变导致了其降低表达量,并产生了不同于前人研究的新表型,这为深入研究OsMADS1基因在水稻花器官发育中的功能提供了新的种质资源和思路。
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| 关 键 词： | 水稻 基因定位 图位克隆 内颖畸形或缺失 |
Map-based Cloning and Expression Analysis of Rice Abnormal or Absent Palea Gene OsAPP1 |
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| CHEN Xiao-dong,LI Fei,LI Dan-yang,LIU Ling-zhi,QIAO Shou-chen,SUN Hong-zheng,LI Jun-zhou,ZHANG Jing,PENG Ting,TAN Jin-fang,DU Yan-xiu,ZHAO Quan-zhi.Map-based Cloning and Expression Analysis of Rice Abnormal or Absent Palea Gene OsAPP1[J].Journal of Plant Genetic Resources,2021(2):416-426. |
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| Authors: | CHEN Xiao-dong LI Fei LI Dan-yang LIU Ling-zhi QIAO Shou-chen SUN Hong-zheng LI Jun-zhou ZHANG Jing PENG Ting TAN Jin-fang DU Yan-xiu ZHAO Quan-zhi |
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| Institution: | (College of Agriculure.Henan Agricultural University/Henan Key Laboratory of Rice Biology,Zhengzhou 450002;Collge of Agriculure,Sun Yat-sen Universiry,Guangzhou 510006) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rice gene mapping map-based cloning abnormal or absent palea |
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