| 黄瓜多样性固定核心样本集的构建与评价 |
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| 引用本文： | 张微,李斯更,沈镝,李锡香.黄瓜多样性固定核心样本集的构建与评价[J].植物遗传资源学报,2016,17(3):404-415. |
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| 作者姓名： | 张微 李斯更 沈镝 李锡香 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所/农业部蔬菜作物基因资源与种质创制北京科学观测实验站,北京,100081 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31171961） |
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| 摘 要： | 利用149对具有多态性的In Del引物对473份黄瓜初选核心种质自交系进行遗传多样性分析。采用3种方法 12种取样比例对该初级遗传多样性固定群体进行抽样获得候选多样性固定核心样本集(GDFCC),使用等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon's信息指数(I)、基因多样性指数(gene diversity)、多态性信息含量(PIC)、总等位位点数(total number of loci)、等位位点保留百分率(retention rate of loci)评价候选多样性固定核心样本集的多样性和代表性,结果表明,采用逐级聚类+稀有基因优先取样法并按照15%取样比例构建出的多样性固定核心样本集的效果较好。比较发现,该核心样本集的Ne、I、基因多样性指数和PIC值均接近或高于初级遗传多样性固定群体,且对原始群体的等位位点的保留百分率为99.68%。入选多样性固定核心样本集的材料来自15个国家和国内18个省市。该研究为今后黄瓜优异基因资源的挖掘利用提供了代表性强、覆盖度广、遗传稳定的研究群体,将有利于黄瓜种质资源的高效研究利用。
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| 关 键 词： | 黄瓜 InDel标记 核心种质 遗传多样性固定群体 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2015/4/26 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/12/7 0:00:00 |
Establishment and Analyses of a Genetic Diversity Dixed Core Collection of Cucumber(Cucumis sativus L.) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cucumber InDel marker core collection genetic diversity fixed core collection genetic diversity |
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