| 菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析 |
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| 引用本文： | 张婷,张双喜,裴丽丽,于太飞,陈明,李连城,周永斌,马有志,徐强,徐兆师.菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析[J].植物遗传资源学报,2014,15(6):1334-1341. |
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| 作者姓名： | 张婷 张双喜 裴丽丽 于太飞 陈明 李连城 周永斌 马有志 徐强 徐兆师 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院作物科学研究所 |
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| 基金项目： | 转基因生物新品种培育科技重大专项(2014ZX08002-002,2014ZX08003-004B) |
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| 摘 要： | 锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一,在多种细胞活动中主要介导蛋白质-蛋白质的相互作用。本研究利用菜豆基因组数据库,通过生物信息学手段对菜豆ANK家族成员及分子生物学特性进行了鉴定。结果显示,菜豆基因组中含有30个ANK家族基因,分布于9条染色体上,其中第5条染色体上含有的ANK基因最多,包含13个基因。蛋白结构域分析发现,ANK25除了含有ANK结构域外还含有RING结构域。亚细胞定位结果显示,ANK25主要分布在细胞膜上。表达模式分析发现,ANK25对干旱、盐和ABA胁迫有响应。本研究为进一步研究菜豆ANK的分类及功能提供了有利的依据。
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| 关 键 词： | ANK重复序列 生物信息学 亚细胞定位 表达模式 菜豆 |
| 收稿时间： | 2014/6/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2014/7/12 0:00:00 |
Genome-wide analysis of ANK gene family and expression pattern of the ANK25 gene in Snap Bean |
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| Xu Zhao-Shi.Genome-wide analysis of ANK gene family and expression pattern of the ANK25 gene in Snap Bean[J].Journal of Plant Genetic Resources,2014,15(6):1334-1341. |
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| Authors: | Xu Zhao-Shi |
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| Institution: | ZHANG Ting;ZHANG Shuang-xi;PEI Li-li;YU Tai-fei;CHEN Ming;LI Lian-cheng;ZHOU Yong-bin;MA You-zhi;XU Qiang;XU Zhao-shi;College of Horticulture,An Hui Agricultural University;Institute of Crop Sciences,Chinese Academy of Agricultural Sciences(CAAS)/National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement/Key Laboratoryof Biology and Genetic Improvement of Triticeae Crops,Ministry of Agriculture;Institute of Crop Sciences,Ningxia Academy of Agricultural Sciences; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ankyrin repeats bioinformatics subcellular localization expression pattern Snap Bean |
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