中国野生葡萄mybA转录因子SNP特征分析

本研究以中国野生葡萄14个种为材料，对控制花色苷合成的mybA转录因子进行克隆和序列分析，获得VvmybA1和VlmybA2两个转录因子的全长基因序列，共检测到121个SNP，表现出丰富的遗传多样性。3种中性检测方法比较序列变异模式，结果表明，中国野生种葡萄VvmybA1和VlmybA2基因没有偏离中性模型，反映出基因漂移和选择性中性突变之间的平衡。不同野生种材料的mybA 基因结构存在很高的同源相似性。但是在启动子区、内含子区以及第三个外显子区存在不同程度碱基的缺失、插入和替换，而且野生种葡萄mybA基因存在一些特有序列或突变，这些突变可以作为分子标记区分不同的野生种材料。通过基因结构比对和系统进化树分析，可将野生种葡萄细分为5个类群。初步推测桦叶葡萄和变叶葡萄进化地位较为原始。