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芒果NBS类抗病基因同源序列克隆与分析
引用本文:刘洋.芒果NBS类抗病基因同源序列克隆与分析[J].植物遗传资源学报,2013,14(3):571-576.
作者姓名:刘洋
作者单位:中国热带农业科学院湛江实验站
基金项目:国家自然科学基金项目(No. 30760147);海南省自然科学基金项目(No. 311092);中央公益性科研基本业务费项目(No.ITBB120504)共同资助
摘    要:根据已知物种NBS抗病类基因(RGAs)保守序列设计引物,从芒果品种“金煌”基因组DNA中分离得到了10条同源序列(pp-1~10,GenBnak登录号为HM446507~16)。DNA序列分析表明,这些RGAs在200~300bp区间存在较大变异,Pi值都在0.4以上。同源性分析表明这些序列的同源性差异范围从11.0%~98.4%,离散值范围为1.6~100.7, 10条RGAs可以分为两大类。蛋白序列分析表明,pp-1~10都具有开放读码框,编码的蛋白含有典型的NBS抗病类基因所拥有的P-loop和Kinase-2a结构域,通过同源进化分析可将其分为TIR-NBS-LRR和CC-NBS-LRR两类,与已知物种同源性分别为22%~60%。

关 键 词:芒果  NBS  抗病类基因  同源克隆  聚类分析
收稿时间:2012/7/13 0:00:00
修稿时间:2012/10/25 0:00:00

Isolation and Characterization of NBS type Resistance Gene Analogs from Mango (Mangifera indica Linn.)
liuyang.Isolation and Characterization of NBS type Resistance Gene Analogs from Mango (Mangifera indica Linn.)[J].Journal of Plant Genetic Resources,2013,14(3):571-576.
Authors:liuyang
Abstract:
Keywords:Mango (Mangifera indica Linn  )  NBS  RGAs  Cloning    Cluster analysis
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